R语言 CGEN包 SNPdata()函数中文帮助文档(中英文对照)

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SNPdata(CGEN)
SNPdata()所属R语言包：CGEN

                                         Sample genotype data
                                         样品基因型数据

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Sample genotype data for snp.scan.logistic
snp.scan.logistic样品基因型数据


Details

详情----------Details----------

GenotypeData.txt is a type 2 data file (see file.type in snp.list). This data contains 230 SNPs and 1579 subjects, and is delimited by a bar ("|"). The first row of the data contains the subject ids. Starting from row 2, are the SNP ids and the genotypes for each subject. The genotypes are coded as 0, 1, or 2 with NA to denote a missing genotype. The data for the first 3 SNPs and 5 subjects are: <br> <br> sub455|sub1244|sub645|sub1392|sub1482 <br> rs11102647|NA|AT|AT|TT|AA <br> rs6695241|CC|CG|CC|CC|CG <br> rs12567796|NA|NA|CG|NA|CG <br>
GenotypeData.txt是一个类型的数据文件（参见file.typesnp.list）。此数据包含230个SNPs和1579科目，是由一间条形（“|”）分隔。数据的第一行包含主题的IDS。从第2行，SNP ID和每个科目的基因型。基因型编码NA表示缺失基因型为0，1或2。第3个SNPs和5个科目的数据是：参考参考sub455 | sub1244 | sub645 | sub1392 | sub1482参考rs11102647 |北美| AT的AT | TT | AA参考rs6695241 |抄送|企业管治| CC | CC |企业管治参考rs12567796 | NA |北美| CG |北美|企业管治参考


举例----------Examples----------


# Load and print a substring the first 5 lines[加载和打印一个子串的第5行]
data(SNPdata, package="CGEN")

substring(SNPdata[1:5], 1, 50)

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