dataAKT_I(varcompci)
dataAKT_I()所属R语言包:varcompci
Gene Response Characterization of AKT inhibitors
AKT抑制剂的基因响应特性
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
The report shows the results from two experiments (GSE18232, GSE18005) that could be used to determine the gene response to AKT inhibitors; data set taken from Krech et al. (2010).
该报告结果示于从两个的实验(GSE18232,GSE18005),可以用来确定基因响应于AKT抑制剂;数据集采取从Krech等进行。 (2010年)。
用法----------Usage----------
data(dataAKT_I)
格式----------Format----------
This data frame contains: kth measurement of the gth gene expression of jth chemical compound of the ith group evaluated in the k-th cell line. In other words, 5 chemical compounds which act as AKT ihibitors (group 1) were tested versus 4 chemical compounds which are not characterized as a direct AKT1 inhibitors (group 2) over three different cell lines (HCT116, HT29 and SW480). It is assumed that the ith group evaluated is a fixed effect, whileas the effect of the jth compound within the ith group is a random effect. The data were evaluated by analysis of variance (ANOVA) based on a nested model.
此数据框包含:第k个测量评价的第k个单元系的第i组的第j个的化合物的第g个基因的表达。换言之,5作为的AKT ihibitors(第1组)的化合物作用,相对于4的化学化合物,其没有直接AKT1的抑制剂(第2组)在三个不同的单元系(HCT116,HT29和SW480)作为其特征在于,测试。假定第i个组评估是一个固定的效果,而仅仅内的第i组的第j个化合物的效果是一个随机的效果。的数据通过方差分析(ANOVA),一个嵌套的模型的基础上进行评价。
源----------Source----------
Krech T, Thiede M, Hilgenberg E, Schadfer R, Jaijrchott K. (2010). Characterization of AKT independent effects of the synthetic AKT inhibitors SH-5 and SH-6 using an integrated approach combining transcriptomic profiling and signaling pathway perturbations. BMC Cancer. Jun 14;10:287.
Hilgenberg蒂德中号,Krech T,E,Schadfer R,:Jaijrchott,K.(2010)。表征AKT独立AKT抑制剂的合成SH-5和SH-6采用综合的方法相结合的转录组分析和信号转导通路扰动的影响。 BMC癌症。 6月14日10:287。
参考文献----------References----------
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