R语言 varbvs包 create.data()函数中文帮助文档(中英文对照)

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create.data(varbvs)
create.data()所属R语言包：varbvs

                                        Simulate SNP data
                                         模拟SNP数据

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Generates samples of the genotypes and quantitative trait (i.e. a continuous outcome Y) according to the specified SNP minor
生成样本的基因型和数量性状的（即连续的结果Y），根据指定的SNP小调


用法----------Usage----------


create.data(maf, beta, sigma, n)



参数----------Arguments----------

参数：maf
vector giving minor allele frequencies of the SNPs.
矢量给未成年人的SNP等位基因频率。


参数：beta
vector of the same length giving the additive effects of the SNPs.
给予的单核苷酸多态性的累加效应相同的长度的矢量。


参数：sigma
positive scalar specifying the variance of residual.
正标量指定剩余的方差。


参数：n
number of samples to generate.
要生成的样本数。


Details

详细信息----------Details----------

Genotypes are generated from a binomial distribution with success rates given by the minor allele frequencies. Observations about the quantitative trait are generated according to y =   X*beta + e, where the residual e is normal with mean zero and
基因型产生的二项式分布的次要等位基因频率的成功率。有关的数量性状的观测产生的根据y =   X*beta + e的，其中的剩余e是正常的均值为零，


值----------Value----------

Returns a list containing two components:
返回一个列表，其中包含两个组成部分：


参数：X
matrix of genotype data with centered columns so that the mean of each column is zero.
与中心的列，以使每一列的平均值为零的基因型数据矩阵。


参数：y
vector of quantitative trait data, centered so that the mean of the vector entries is zero.
向量的数量性状数据为中心，使得向量项的平均值是零。


（作者）----------Author(s)----------


Peter Carbonetto



参见----------See Also----------

create.snps
create.snps


实例----------Examples----------



## Randomly generate genotypes and quantitative trait measurements for[＃随机生成基因型和数量性状的测量]
## 1000 SNPs and 200 individuals, in which the variance of the residual[＃1000 SNPs和200个个体，其中所述的残余方差]
## error is 4. Of these SNPs, 10 have nonzero additive effects on the[＃误差为4。这些SNPs中，有非零的加性效应]
## trait.[＃特征。]
se   <- 4
snps <- create.snps(1000,10)
data <- create.data(snps$maf,snps$beta,se,200)

## Calculate the proportion of variance in the quantitative trait[＃计算方差的比例在数量性状]
## explained by the SNPs.[＃解释的单核苷酸多态性。]
sz <- var(c(data$X %*% snps$beta))
sz/(sz + se)


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