R语言 CellNOptR包 cutAndPlotResultsT1()函数中文帮助文档(中英文对照)

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cutAndPlotResultsT1(CellNOptR)
cutAndPlotResultsT1()所属R语言包：CellNOptR

                                         Plot the results of an optimisation at t1
                                         绘制优化的结果，在t1

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function takes a model and an optimised bitstring, it cuts the model according to the bitstring and plots the results of the simulation along with the experimental data.
这个函数接受一个模型和优化的比特串，切模型，根据模拟结果与实验数据的比特串和图。


用法----------Usage----------


cutAndPlotResultsT1(Model, bString, SimList, CNOlist, indexList, plotPDF = FALSE)



参数----------Arguments----------

参数：Model
a model (the full one that was used for optimisation)  
模型（一个用于优化）


参数：bString
a bitstring for T1  as output by gabinaryT1 (i.e. a vector of 1s and 0s)  
由gabinaryT1（即1和0的向量）T1的输出比特串


参数：SimList
a simlist corresponding to the model, as output by prep4Sim  
1 simlist相应的模型作为输出，由prep4Sim


参数：CNOlist
a CNOlist, corresponding to the optimisation one  
1 CNOlist，相应的优化一


参数：indexList
an indexList, produced by indexFinder ran on the model and the CNOlist above  
一个indexList，indexFinder生产运行模式和CNOlist以上


参数：plotPDF
TRUE or FALSE; tells whether you want a pdf to be produced or not  
TRUE或FALSE，告诉您是否要以产生PDF或


值----------Value----------

This function doesn't return anything, it only plots the graph in your graphic window, and in a pdf file if asked
这个函数不返回任何东西，它只是在图形窗口中绘制图，并在一个PDF文件，如果问


作者（S）----------Author(s)----------



C.Terfve




参见----------See Also----------

gabinaryT1, prep4Sim
gabinaryT1，prep4Sim


举例----------Examples----------


#load data[数据加载]

data(CNOlistToy,package="CellNOptR")
data(ToyModel,package="CellNOptR")

#pre-process model[预过程模型]

checkSignals(CNOlistToy,ToyModel)
indicesToy<-indexFinder(CNOlistToy,ToyModel,verbose=FALSE)
ToyNCNOindices<-findNONC(ToyModel,indicesToy,verbose=FALSE)
ToyNCNOcut<-cutNONC(ToyModel,ToyNCNOindices)
indicesToyNCNOcut<-indexFinder(CNOlistToy,ToyNCNOcut)
ToyNCNOcutComp<-compressModel(ToyNCNOcut,indicesToyNCNOcut)
indicesToyNCNOcutComp<-indexFinder(CNOlistToy,ToyNCNOcutComp)
ToyNCNOcutCompExp<-expandGates(ToyNCNOcutComp)

#optimise[优化]

ToyFields4Sim<-prep4Sim(ToyNCNOcutCompExp)
initBstring<-rep(1,length(ToyNCNOcutCompExp$reacID))
ToyT1opt<-gaBinaryT1(
        CNOlist=CNOlistToy,
        Model=ToyNCNOcutCompExp,
        SimList=ToyFields4Sim,
        indexList=indicesToyNCNOcutComp,
        initBstring=initBstring,
        maxGens=2,
        PopSize = 5,
        verbose=FALSE)
cutAndPlotResultsT1(
        Model=ToyNCNOcutCompExp,
        bString=ToyT1opt$bString,
        SimList=ToyFields4Sim,
        CNOlist=CNOlistToy,
        indexList=indicesToyNCNOcutComp,
        plotPDF=FALSE)

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