compressModel(CellNOptR)
compressModel()所属R语言包:CellNOptR
Compress a model
压缩模型
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function compresses a model by compressing species that are not signals/inhibited/stimulated and that are not dead ends/in complex logic (i.e. only species with either one input or one output are compressed)/in self loops.
此功能压缩通过压缩没有信号/抑制/刺激,不死角,在复杂的逻辑(即只与其中一个输入或输出物种被压缩)/ /在自我循环的物种模型。
用法----------Usage----------
compressModel(Model, indexes)
参数----------Arguments----------
参数:Model
a model structure as produced by readSif
作为一个模型结构由readSif生产
参数:indexes
list of indexes of sthe species stimulated/inhibited/measured in the model, as created by indexFinder
指标sthe物种名单的刺激/抑制/测量的模型,作为由indexFinder创建
Details
详情----------Details----------
Be aware that in the multiple inputs/one output case, if one of the outputs is an '&' gate this function handles it fine as long as it is an '&' with 2 inputs and no more.
要知道,在多输入/单输出的情况下,如果输出是一个和门这个功能,只要处理罚款,因为它是一个&2的投入并没有更多。
值----------Value----------
a compressed model list, with an additional field called 'speciesCompressed' that contains the names of the species that have been compressed
一个压缩的模型列表,与称为“speciesCompressed”一个额外的字段,它包含的物种已被压缩的名字
作者(S)----------Author(s)----------
C.Terfve
参见----------See Also----------
indexFinder, readSif
indexFinder,readSif
举例----------Examples----------
#load data[数据加载]
data(CNOlistToy,package="CellNOptR")
data(ToyModel,package="CellNOptR")
indicesToy<-indexFinder(CNOlistToy,ToyModel,verbose=FALSE)
ToyComp<-compressModel(ToyModel,indicesToy)
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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