R语言 CellNOptR包 CellNOptR-package()函数中文帮助文档(中英文对照)

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CellNOptR-package(CellNOptR)
CellNOptR-package()所属R语言包：CellNOptR

                                         R version of CellNOptR, boolean features
                                         CellNOptR R版本，布尔功能

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This package does optimisation of boolean logic networks of signalling pathways based on a previous knowledge network and a set of data collected upon perturbation of some of the nodes in the network.
这包不上以前的知识网络和一些网络节点扰动时收集到的数据集为基础的信号通路的布尔逻辑网络优化。


Details

详情----------Details----------


作者（S）----------Author(s)----------



C.Terfve
Maintainer: C.Terfve <terfve@ebi.ac.uk>




参考文献----------References----------

mammalian signal transduction, Molecular Systems Biology, 5:331, 2009.

举例----------Examples----------


library(CellNOptR)

tmpdir<-tempdir()
setwd(tmpdir)

data(CNOlistToy,package="CellNOptR")
data(ToyModel,package="CellNOptR")

#From here there are 2 versions: 1. If you want to set the parameters yourself[从这里有2个版本：1。如果你想自己设置参数]
pList<-list(
        Data=CNOlistToy,
        Model=ToyModel,
        sizeFac = 1e-04,
        NAFac = 1,
        PopSize = 10,
        Pmutation = 0.5,
        MaxTime = 60,
        maxGens = 5,
        StallGenMax = 5,
        SelPress = 1.2,
        elitism = 5,
        RelTol = 0.1,
        verbose=TRUE)

CNORwrap(
        paramsList=pList,
        Name="Toy",
        NamesData=list(CNOlist="ToyData",Model="ToyModel"),
        Data=NA,
        Model=NA)

#2. If you want to keep the default parameters[2。如果你想保持默认参数]
## Not run: [＃无法运行：]
CNORwrap(
        paramsList=NA,
        Name="Toy",
        NamesData=list(CNOlist="ToyData",Model="ToyModel"),
        Data=CNOlistToy,
        Model=ToyModel)

## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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