R语言 untb包 optimal.params.sloss()函数中文帮助文档(中英文对照)

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optimal.params.sloss(untb)
optimal.params.sloss()所属R语言包：untb

                                         Estimation of neutral community parameters using a two-stage maximum-likelihood procedure
                                         中性社区参数估计，使用一个两阶段的最大似然程序

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Function optimal.params.sloss() returns maximum likelihood estimates of theta and m(k) using numerical optimization.
函数optimal.params.sloss()返回最大似然估计的theta和m(k)使用数值优化。

It differs from untb's optimal.params() function as it applies to a network of smaller community samples k instead of to a single large community sample.
它不同于untb的optimal.params()功能，因为它适用于网络规模较小的社区样本k，而不是一个大的社区样本。

Although there is a single, common theta for all communities, immigration estimates are provided for each local community k, sharing a same biogeographical background.
虽然是一个单一的，共同的theta所有社区，移民估计提供各乡镇k，共享相同的生物GEO背景。


用法----------Usage----------


optimal.params.sloss(D, nbres = 100, ci = FALSE, cint = c(0.025, 0.975))



参数----------Arguments----------

参数：D
Species counts over a network of community samples (species by sample table)  
物种数示例表在网络上的社区样本（种）


参数：nbres
Number of resampling rounds for theta estimation
的重采样轮theta估计数


参数：ci
Specifies whether bootstraps confidence intervals should be provided for estimates  
指定是否应为估计人头地的置信区间


参数：cint
Bounds of confidence intervals, if ci = T  
界的置信区间，如果Ci = T


值----------Value----------


参数：theta
Mean theta estimate
平均theta估计


参数：I
The vector of estimated immigration numbers I(k)
的向量，估计移民的数字I(k)

Output of the bootstrap procedure, if ci = T:
输出自举程序，如果Ci = T：


参数：thetaci
Confidence interval for theta
置信区间为theta


参数：msampleci
Confidence intervals for m(k)
置信区间为m(k)


参数：thetasamp
theta estimates provided by the resampling procedure
THETA估计的重采样程序


参数：Iboot
Bootstrapped values of I(k)
自举值I(k)


参数：mboot
Bootstrapped values of m(k)
自举值m(k)


（作者）----------Author(s)----------


Francois Munoz



参考文献----------References----------

2007. “Estimating parameters of neutral communities: from one single large to several small samples”. Ecology 88(10):2482-2488

参见----------See Also----------

optimal.params, optimal.params.gst
optimal.params，optimal.params.gst


实例----------Examples----------


data(ghats)
optimal.params.sloss(ghats)

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