R语言 untb包 optimal.params.gst()函数中文帮助文档(中英文对照)

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optimal.params.gst(untb)
optimal.params.gst()所属R语言包：untb

                                         Estimation of local immigration using GST(k) statistics
                                         估计当地的移民GST（K）的统计

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Functions optimal.params.gst(), GST.k() and I.k() apply to count data collected over a network of community samples k (species by sample matrix).  A theoretical relationship between GST(k) statistics and local immigration numbers I(k), in the context of a spatially-implicit neutral community model (Munoz et al 2008), is used to provide GST(k) and I(k) statistics any sample k.
功能optimal.params.gst()，GST.k()和I.k()适用于通过网络社区样本K（种样品基体）收集的数据进行计数。的理论之间的关系GST(k)统计和当地的移民数字I(k)，在一个空间隐式的中立的社会模型（穆尼奥斯等人，2008年）的背景下，用于提供GST(k)和I(k)的任何样本k统计。

If requested, optimal.params.gst() further provides the user with confidence bounds.
如果有要求，optimal.params.gst()进一步为用户提供了与置信区间。


用法----------Usage----------


optimal.params.gst(D, exact = TRUE, ci = FALSE, cint = c(0.025, 0.975), nbres = 100)
GST.k(D, exact = TRUE)
I.k(D, exact = TRUE)



参数----------Arguments----------

参数：D
A data table including species counts in a network of community samples (columns)  
一个数据表包括物种计数的网络社区样本（列）


参数：exact
If TRUE, exact similarity statistics are calculated (sampling without replacement) while, if false, approximate statistics (sampling with replacement) are considered (see Munoz et al 2008 for further statistical discussion)
如果TRUE，确切的相似性统计计算（无需更换采样），同时，如果被认为是假的，近似统计（抽样更换）（见穆尼奥斯等人，2008年统计为进一步讨论）


参数：ci
Specifies whether bootstraps confidence intervals of immigration estimates are to be calculated
指定是否白手起家的移民估计的置信区间来计算的


参数：cint
Bounds of the confidence interval, if ci = TRUE  
界的置信区间，如果ci = TRUE


参数：nbres
Number of rounds of the bootstrap procedure for confidence interval calculation, if ci = T
数轮的自举程序为置信区间计算，如果Ci = T


值----------Value----------


参数：GST
A vector of 0 to 1 GST(k) numbers (specific output of GST.k)
为0~1GST(k)号码（GST.k的特定的输出）的向量


参数：nk
Number of individuals within samples (length = number of samples)
样品（长度内的个人数=样本数）


参数：distrib
Species counts of the merged dataset (output of GST.k and I.k)
物种数量的合并数据集（输出GST.k和I.k）


参数：I
Immigration estimates (output of I.k and optimal.params.gst)
入境事务处估计数（输出I.k和optimal.params.gst）


参数：m
Corresponding immigration rates (output of I.k and optimal.params.gst).  Specific outputs of optimal.params.gst when ci = T (bootstrap procedure)
相应的移民率（输出I.k和optimal.params.gst）。具体产出的optimal.params.gst当CI = T时，（引导程序）


参数：Ici
Confidence interval of I(k)
置信区间I(k)


参数：mci
Confidence interval of m(k)
置信区间m(k)


参数：Iboot
Table of bootstrapped values of I(k)
表的自举值I(k)


参数：mboot
Table of bootstrapped values of im(k)
表的自举值，我m(k)


（作者）----------Author(s)----------


Francois Munoz



参考文献----------References----------

(2008). “Beta-diversity in spatially implicit neutral models: a new way to assess species migration.” The American Naturalist 172(1): 116-127

参见----------See Also----------

optimal.params,optimal.params.sloss
optimal.params，optimal.params.sloss


实例----------Examples----------


data(ghats)
optimal.params.gst(ghats)

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