R语言 unmarked包 unmarkedFrameOccu()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

unmarkedFrameOccu(unmarked)
unmarkedFrameOccu()所属R语言包：unmarked

                                        Organize data for the single season occupancy models fit by occu and
                                         组织数据的单季占用的模式适合的占用和

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Organizes detection, non-detection data along with the covariates.  This S4 class is required by the data argument of occu and
组织检测，未检测到的数据，以及协变量。 S4类的数据参数occu


用法----------Usage----------


unmarkedFrameOccu(y, siteCovs=NULL, obsCovs=NULL, mapInfo)



参数----------Arguments----------

参数：y
An RxJ matrix of the detection, non-detection data, where R is the  number of sites, J is the maximum number of sampling periods per site.
一种RXJ矩阵的检测，非检测数据，其中R是的站点数，J是采样周期每个站点的最大数目。


参数：siteCovs
A data.frame of covariates that vary at the  site level. This should have M rows and one column per covariate
Adata.frame在站点级别的不同的协变量。这应该具有M行和一列，每协变量


参数：obsCovs
Either a named list of data.frames of  covariates that vary within sites, or a data.frame with  RxJ rows in site-major order.
data.frame的一个命名列表网站内变化的协变量，或一个data.frame网站主要为了RXJ行。


参数：mapInfo
Currently ignored
目前被忽略


Details

详细信息----------Details----------

unmarkedFrameOccu is the S4 class that holds data to be passed  to the occu and occuRN model-fitting function.
unmarkedFrameOccu是S4级保存数据要传递给occu和occuRN模型拟合功能。


值----------Value----------

an object of class unmarkedFrameOccu
一个类unmarkedFrameOccu的对象


参见----------See Also----------

unmarkedFrame-class, unmarkedFrame,
unmarkedFrame-class，unmarkedFrame，


实例----------Examples----------



# Fake data[假数据]
R <- 4 # number of sites[一些网站]
J <- 3 # number of visits[访问次数]
y <- matrix(c(
   1,1,0,
   0,0,0,
   1,1,1,
   1,0,1), nrow=R, ncol=J, byrow=TRUE)
y

site.covs <- data.frame(x1=1:4, x2=factor(c('A','B','A','B')))
site.covs

obs.covs <- list(
   x3 = matrix(c(
      -1,0,1,
      -2,0,0,
      -3,1,0,
      0,0,0), nrow=R, ncol=J, byrow=TRUE),
   x4 = matrix(c(
      'a','b','c',
      'd','b','a',
      'a','a','c',
      'a','b','a'), nrow=R, ncol=J, byrow=TRUE))
obs.covs

umf <- unmarkedFrameOccu(y=y, siteCovs=site.covs,
    obsCovs=obs.covs)   # organize data[组织数据]
umf                     # look at data[看数据]
summary(umf)            # summarize      [总结]
fm &lt;- occu(~1 ~1, umf)  # fit a model[拟合模型]



转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。