R语言 unmarked包 unmarkedFrameDS()函数中文帮助文档(中英文对照)

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unmarkedFrameDS(unmarked)
unmarkedFrameDS()所属R语言包：unmarked

                                        Organize data for the distance sampling model of Royle et al. (2004)
                                         组织罗伊尔等的距离采样模式的数据。 （2004）

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Organizes count data along with the covariates and metadata.
组织计数数据一起的协变量和元数据。


用法----------Usage----------





参数----------Arguments----------

参数：y
An RxJ matrix of count data, where R is the number of sites (transects) and J is the number of distance classes.
一种RXJ计数数据的矩阵，其中R是网站（断面）的数目和J是距离类的数量。


参数：siteCovs
A data.frame of covariates that vary at the site level. This should have R rows and one column per covariate
Adata.frame在站点级别的不同的协变量。这应该有R行和一列的每协变量


参数：dist.breaks
vector of distance cut-points delimiting the distance classes. It must be of length J+1.
矢量的距离切点分隔的距离类。它必须是长度为J +1。


参数：tlength
A vector of length R containing the trasect lengths. This is ignored when survey="point".
一个向量的长度R包含trasect的长度。 =“点”时，将忽略此调查。


参数：survey
Either "point" or "line" for point- and line-transects.
无论是“点”或“线”点和线断面。


参数：unitsIn
Either "m" or "km" defining the measurement units for both dist.breaks and tlength </table>
“m”或“公里”定义的测量单位都dist.breaks和tlength</表>


参数：mapInfo
Currently ignored </table>
目前忽略</ TABLE>


Details

详细信息----------Details----------

unmarkedFrameDS is the S4 class that holds data to be passed
unmarkedFrameDS是S4的类，用于保存数据传递


值----------Value----------

an object of class unmarkedFrameDS
对象的类unmarkedFrameDS的


注意----------Note----------

If you have continuous distance data, they must be "binned" into
如果你有连续的距离数据，他们必须在“离散化”成


参考文献----------References----------

abundance effects in distance sampling. Ecology 85, pp. 1591-1597.

参见----------See Also----------

unmarkedFrame-class, unmarkedFrame,
unmarkedFrame-class，unmarkedFrame，


实例----------Examples----------



# Fake data[假数据]
R &lt;- 4 # number of sites[一些网站]
J &lt;- 3 # number of distance classes[距离班数]

db &lt;- c(0, 10, 20, 30) # distance break points[距离破发点，]

y <- matrix(c(
   5,4,3, # 5 detections in 0-10 distance class at this transect[在这样的检测0-10距离级]
   0,0,0,
   2,1,1,
   1,1,0), nrow=R, ncol=J, byrow=TRUE)
y

site.covs <- data.frame(x1=1:4, x2=factor(c('A','B','A','B')))
site.covs

umf <- unmarkedFrameDS(y=y, siteCovs=site.covs, dist.breaks=db, survey="point",
    unitsIn="m")            # organize data[组织数据]
umf                         # look at data[看数据]
summary(umf)                # summarize[总结]
fm &lt;- distsamp(~1 ~1, umf)  # fit a model[拟合模型]



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