ROC-class(cellHTS2)
ROC-class()所属R语言包:cellHTS2
Class that contain data that can be plotted as a ROC curve.
类,它包含可以作为ROC曲线绘制的数据。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Container for data that represent a receiver-operator-characteristic curve, and that were generated from the data of the annotated positive and negative controls in a scored cellHTS object.
集装箱,代表了接收操作特性曲线,从正面和负面的注解控制在1拿下cellHTS对象的数据生成的数据。
创建对象----------Creating Objects----------
new("ROC")
new("ROC")
ROC(object, positives, negatives) with object being an cellHTS instance.
ROC(object, positives, negatives)与objectcellHTS实例。
插槽----------Slots----------
name: a character of length 1 with the name of the experiment from which the ROC object derives.
name:一个字符的派生实验中华民国对象名称与长度为1。
assayType: a character of length 1 with the type of screenning assay. Possible values are: "one-way assay" and "two-way assay".
assayType:screenning检测的类型1长度与性格。可能的值是:“单向法”和“双向法”。
TP: a vector of integers of length 1000.
TP:向量的长度为1000的整数。
FP: a vector of integers of length 1000.
FP:向量的长度为1000的整数。
posNames: a character vector with the name of the positive controls.
posNames:特征向量与阳性对照的名称。
negNames: a character vector with the name of the negative controls.
negNames:特征向量与阴性对照组的名称。
方法----------Methods----------
show Print a summary of the object.
show打印一个对象的总结。
plot Plot the ROC curve corresponding to the object.
plot绘制ROC曲线相应的对象。
lines Line plot of the ROC object.
lines中华民国对象的线图。
作者(S)----------Author(s)----------
Ligia Bras <a href="mailto:ligia@ebi.ac.uk">ligia@ebi.ac.uk</a>, Wolfgang Huber <a href="mailto:huber@ebi.ac.uk">huber@ebi.ac.uk</a>
参见----------See Also----------
ROC
ROC
举例----------Examples----------
showClass("ROC")
showMethods(class="ROC")
## Not run: [#无法运行:]
data(KcViabSmall)
x <- normalizePlates(KcViabSmall, scale="multiplicative", log=FALSE, method="median", varianceAdjust="none")
x <- scoreReplicates(x, sign="-", method="zscore")
x <- summarizeReplicates(x, summary="mean")
y <- ROC(x)
plot(y)
lines(y, col="green")
show(y)
## End(Not run)[#结束(不运行)]
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
|