predict.uniCox(uniCox)
predict.uniCox()所属R语言包:uniCox
Function to compute the linear predictor from a coxUniv fit
从coxUniv适合函数来计算的线性预测
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Function to compute the linear predictor from a coxUniv fit
从coxUniv适合函数来计算的线性预测
用法----------Usage----------
predict.uniCox(object,x,...)
参数----------Arguments----------
参数:object
Object returned by uniCox
返回的对象uniCox
参数:x
Feature matrix, n obs by p variables
特征矩阵,n p个变量的OB
参数:...
Included for compatibility with generic predict function
包括的兼容性与通用的预测功能
Details
详细信息----------Details----------
This function compute the linear predictor from a coxUniv fit
这个函数计算从coxUniv适合的线性预测
值----------Value----------
A matrix of dimension (number rows of x) by ( number of lambda values), representing the predictions x
维的矩阵(行编号为x)(lambda值的数量),较预测x
源----------Source----------
Tibshirani, R. Univariate shrinkage in the Cox model for high dimensional data (2009). http://www-stat.stanford.edu/~tibs/ftp/cus.pdf To appear SAGMB.
Tibshirani,R. Cox模型的高维数据(2009年)中的单变量收缩。 http://www-stat.stanford.edu/~TIBS / FTP / cus.pdf的的要出现SAGMB的。
实例----------Examples----------
library(survival)
# generate some data[生成一些数据]
x=matrix(rnorm(200*1000),ncol=1000)
y=abs(rnorm(200))
x[y>median(y),1:50]=x[y>median(y),1:50]+3
status=sample(c(0,1),size=200,replace=TRUE)
xtest=matrix(rnorm(50*1000),ncol=1000)
ytest=abs(rnorm(50))
xtest[ytest>median(ytest),1:50]=xtest[ytest>median(ytest),1:50]+3
statustest=sample(c(0,1),size=50,replace=TRUE)
# fit model[拟合模型]
a=uniCox(x,y,status)
# get predictions on a test set[获得测试集上的预测]
yhat=predict.uniCox(a,xtest)
# fit survival model to predicted values for 7th val of lambda[适合生存模型为第7的lambda值的预测值]
coxph(Surv(ytest,statustest)~yhat[,7])
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