R语言 cellHTS2包 plateEffects()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

plateEffects(cellHTS2)
plateEffects()所属R语言包：cellHTS2

                                        Access plate effects stored in a cellHTS object.
                                         接盘存储在cellHTS对象的影响。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This generic function accesses plate effects stored in slot rowcol.effects and overall.effects  of a cellHTS instance.
这个泛型函数访问存储在插槽板效应rowcol.effects和overall.effectscellHTS实例。


用法----------Usage----------


plateEffects(object)



参数----------Arguments----------

参数：object
Object derived from class cellHTS that has been normalized by a spatial normalization method. See details.
对象从cellHTS类派生已标准化的空间归一化法。查看详情。


值----------Value----------

plateEffects returns a list with two elements: rowcol and overall.
plateEffects返回两个元素的一个列表：rowcol和overall。

plateEffects[["rowcol"]] corresponds to the contents of slot rowcol.effects of object. This is a 3D array with the same dimensions as Data(object): nr of Features x nr of Samples x nr of Channels of the current cellHTS object.
plateEffects[["rowcol"]]对应插槽rowcol.effectsobject的内容。这是与Data(object)尺寸相同的三维数组：nr of Features x nr of Samples x nr of Channels当前cellHTS对象。

plateEffects[["overall"]] contains the data stored in slot overall.effects of object. This is a 3D array with dimensions nr Plates x nr Samples x nr Channels of object. Slot overall.effects is only estimated when B score method is used to normalize the data.
plateEffects[["overall"]]包含在插槽overall.effectsobject中存储的数据。这是尺寸nr Plates x nr Samples x nr Channelsobject的三维数组。槽overall.effects估计只当B的得分方法用于数据标准化。

Note that these 2 slots accessed by this function were stored after preprocessing the data either using Bscore method or local regression fit (see normalizePlates for details), by setting the option save.model=TRUE.
注意：此功能访问这2个插槽，存储，预处理后的数据或者使用方法Bscore或局部回归拟合（见normalizePlates细节），通过设置选项save.model=TRUE。


作者（S）----------Author(s)----------


Ligia Bras <a href="mailto:ligia@ebi.ac.uk">ligia@ebi.ac.uk</a>



参见----------See Also----------

cellHTS normalizePlates Bscore spatialNormalization
cellHTSnormalizePlatesBscorespatialNormalization

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注：
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