buildCellHTS2(cellHTS2)
buildCellHTS2()所属R语言包:cellHTS2
Build a cellHTS2 object from a data frame containing measurements
从数据框包含测量建立1 cellHTS2对象
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Builds a cellHTS2 object from a data frame.
构建了数据框cellHTS2的对象。
用法----------Usage----------
buildCellHTS2(xd, measurementNames)
参数----------Arguments----------
参数:xd
a data frame containing the columns plate, replicate and well, and the measurement columns. The plate and replicate columns must contain integer values, starting from 1. The well column must contain well names formed by a capital letter followed by two digits, e.g. A12 or H02.
一个数据框包含列plate,replicate和well,测量列。 plate和replicate列必须包含整数的值,从1开始。 well列必须包含以及名称,由一个大写字母后跟两个数字组成,如A12或H02。
参数:measurementNames
an optional character vector containing the measurement names. If missing, the names of the measurement columns in xd are used. If NULL, the measurements are not named.
一个可选的特征向量包含测量名称。如果丢失,测量列的名字xd使用。如果NULL,测量没有被命名。
Details
详情----------Details----------
The function uses readPlateList to build a cellHTS2 object.
该功能使用readPlateList建立cellHTS2对象。
值----------Value----------
An object of class cellHTS, which extends the class NChannelSet.
一个对象类cellHTS,延伸类的NChannelSet。
作者(S)----------Author(s)----------
Gregoire Pau <a href="mailto:gregoire.pau@embl.de">gregoire.pau@embl.de</a>
参考文献----------References----------
screens, Genome Biology 7, R66.
参见----------See Also----------
readPlateList.
readPlateList。
举例----------Examples----------
wells = sprintf("%s%02d", rep(LETTERS[1:8], each=12), 1:12)
xd = expand.grid(plate=1:3, replicate=1:2, well=wells)
xd$cell.number = rnorm(nrow(xd))
xd$cell.size = rnorm(nrow(xd))
x = buildCellHTS2(xd)
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