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R语言 Category包 makeChrBandGraph()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 14:11:50 | 显示全部楼层 |阅读模式
makeChrBandGraph(Category)
makeChrBandGraph()所属R语言包:Category

                                        Create a graph representing chromosome band annotation data
                                         代表染色体带注释的数据创建一个图表

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function returns a graph object representing the nested structure of chromosome bands (also known as cytogenetic bands). The nodes of the graph are band identifiers.  Each node has a geneIds node attribute that lists the gene IDs that are annotated at the band (the gene IDs will be Entrez IDs in most cases).
此函数返回一个graph对象代表的染色体带嵌套结构(也称为单元遗传学带)。图的节点是带标识。每个节点都有一个geneIds节点属性,列出了乐队(基因ID将是Entrez的标识,在大多数情况下)注释基因标识。


用法----------Usage----------


makeChrBandGraph(chip, univ = NULL)



参数----------Arguments----------

参数:chip
A string giving the annotation source.  For example, "hgu133plus2"
一个字符串,给出注释的源。例如,"hgu133plus2"


参数:univ
A vector of gene IDs (these should be Entrez IDs for most annotation sources).  The annotations attached to the graph will be limited to those specified by univ. If univ is NULL (default), then the gene IDs are those found in the annotation data source.
向量的基因标识(这些应该是最标注来源为Entrez的标识)。图注释将被限制到univ指定的。如果univ是NULL(默认),然后基因标识注释数据源的发现。


Details

详情----------Details----------

This function parses the data stored in the <chip>MAP map from the appropriate annotation data package. Although cytogenetic bands are observed in all organisms, currently, only human and mouse band nomenclatures are supported.
此功能解析<chip>MAP从图相应的注释数据包中存储的数据。虽然遗传学乐队在所有生物体中发现,目前,只有人类和小鼠的乐队术语支持。


值----------Value----------

A graph-class instance.  The graph will be a tree and the root node is labeled for the organism.
一个graph-class实例。图形将是一个树的根节点标记为有机体。


作者(S)----------Author(s)----------


Seth Falcon



举例----------Examples----------


chrGraph <- makeChrBandGraph("hgu95av2.db")
chrGraph

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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