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DatPkg-class(Category)
DatPkg-class()所属R语言包：Category

                                        Class "DatPkg"
                                         类“DatPkg”

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

DatPkg is a VIRTUAL class for representing annotation data packages.
DatPkg是VIRTUAL代表注释数据包的类。

AffyDatPkg is a subclass of DatPkg used to represent standard annotation data packages that follow the format of Affymetrix expression array annotation.
AffyDatPkg是DatPkg用来表示标准注解按照Affymetrix公司的表达阵列注释的格式的数据包的子类。

YeastDatPkg is a subclass of DatPkg used to represent the annotation data packages for yeast.  The yeast chip packages are based on sgd and are internally different from the AffyDataPkg conforming packages.
YeastDatPkgDatPkg用来代表酵母注释数据包的一个子类。酵母芯片封装是基于对新元和内部AffyDataPkg不合格包不同。

Org.XX.egDatPkg is a subclass of DatPkg used to represent the org.*.eg.db organism-level Entez Gene based annotation data packages.
Org.XX.egDatPkg是DatPkg用来代表org.*.eg.db的生物体-级Entez基因为基础的包注释数据的子类。

GeneSetCollectionDatPkg is a subclass of DatPkg used to represent annotations in the form of GeneSetCollection objects which are not based on any annotation packages but are instead derived from custom (user supplied) annotations.  
GeneSetCollectionDatPkg是一个子类DatPkg用来表示注解的形式GeneSetCollection对象，而不是基于任何注释的包，而是将派生自定义（用户提供）注释。


类的对象----------Objects from the Class----------

A virtual Class: No objects may be created from it.
可以从它创建一个虚拟类：无对象。

Given the name of an annotation data package, DatPkgFactory can be used to create an appropriate DatPkg subclass.
鉴于注释的数据包，DatPkgFactory可以用来创建一个合适的DatPkg子类的名称。


插槽----------Slots----------




name A string giving the name of the annotation data package.
注释数据包的名字命名的字符串。


方法----------Methods----------

See showMethods(classes="DatPkg").  The set of methods, ID2EntreizID map between the standard IDs for an organism, or Chip and EntrezIDs, typically to give a way to get the GO terms.  Different organisms, such as S. cerevisae and A. thaliana have their own internal IDs, so we need specialized methods for them.
看到showMethods(classes="DatPkg")。一套方法，ID2EntreizID之间的一个有机体，或芯片和EntrezIDs，标准标识的图通常以一种方式来获得的GO术语。不同的生物体，如S. cerevisae和拟南芥，有自己的内部ID，所以我们需要为他们专门的方法。


作者（S）----------Author(s)----------


Seth Falcon



举例----------Examples----------


DatPkgFactory("hgu95av2")
## Not run: [＃无法运行：]
DatPkgFactory("org.Sc.sgd")
DatPkgFactory("org.Hs.eg.db")
DatPkgFactory("ag")

## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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