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ChrMapLinearMResult-class(Category)
ChrMapLinearMResult-class()所属R语言包：Category

                                        Class "ChrMapLinearMResult"
                                         类“ChrMapLinearMResult”

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This class represents the results of a linear model-based test for systematic changes in a per-gene statistic by chromosome band annotation.  The linearMTest function returns an instance of ChrMapLinearMResult when given a parameter object of class ChrMapLinearMParams.  Most slots can be queried using
这个类表示系统的变化，在每一个基因的统计，由染色体带注释的线性模型为基础的测试结果。 linearMTest函数返回实例ChrMapLinearMResult一类的参数对象时ChrMapLinearMParams。最插槽可以查询使用


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects can be created by calls of the form new("ChrMapLinearMResult", ...), but is more commonly created by callinf linearMTest
创建的对象可以通过检测的形式new("ChrMapLinearMResult", ...)，但更普遍由callinflinearMTest创建


插槽----------Slots----------




pvalues: Object of class "numeric", with the p-values for each term.
pvalues：Object类的"numeric"，每届任期为p值。




pvalue.order: Object of class "integer", the order vector (increasing) for the p-values.
pvalue.order：Object类的"integer"，为了向量为P-值（增加）。




effectSize: Object of class "numeric", with the effect size for each term.
effectSize：对象类"numeric"，每学期的规模效应。




annotation: Object of class "character" ~~
annotation：Object类的"character"~~




geneIds: Object of class "ANY" ~~
geneIds：Object类的"ANY"~~




testName: Object of class "character" ~~
testName：Object类的"character"~~




pvalueCutoff: Object of class "numeric" ~~
pvalueCutoff：Object类的"numeric"~~




minSize: Object of class "integer" ~~
minSize：Object类的"integer"~~




testDirection: Object of class "character" ~~
testDirection：Object类的"character"~~




conditional: Object of class "logical" ~~
conditional：Object类的"logical"~~




graph: Object of class "graph" ~~
graph：Object类的"graph"~~




gsc: Object of class "GeneSetCollection" ~~
gsc：Object类的"GeneSetCollection"~~


延伸----------Extends----------

Class "LinearMResult", directly.
类"LinearMResult"，直接。

Class "LinearMResultBase", by class "LinearMResult", distance 2.
类"LinearMResultBase"，类“LinearMResult”，距离为2。


方法----------Methods----------

None
没有


作者（S）----------Author(s)----------


Deepayan Sarkar, Michael Lawrence



参见----------See Also----------

linearMTest, ChrMapLinearMParams, LinearMResult, LinearMResultBase,
linearMTest，ChrMapLinearMParams，LinearMResult，LinearMResultBase


举例----------Examples----------


showClass("ChrMapLinearMResult")

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