R语言 Category包 applyByCategory()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

applyByCategory(Category)
applyByCategory()所属R语言包：Category

                                        Apply a function to a vector of statistics, by category
                                         应用统计向量的功能，按类别

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

For each category, apply the function FUN to the set of values of stats belonging to that category.
对于每个类别，适用的功能FUN属于这一类的一组值stats。


用法----------Usage----------


applyByCategory(stats, Amat, FUN = mean, ...)



参数----------Arguments----------

参数：stats
Numeric vector with test statistics of interest.
兴趣测试统计的数字向量。


参数：Amat
A logical or numeric matrix: the adjacency matrix of the bipartite genes - category graph. Its rows correspond to the categories, columns to the genes, and TRUE or a numeric value different from 0 indicates membership. The columns are assumed to be aligned with the elements of stats.
逻辑或数字矩阵：邻接矩阵对偶基因 - 类图。它的行对应的类别，列的基因，和TRUE或0表示成员的不同数值。列假设与stats的元素对齐。


参数：FUN
A function to apply to the subsets stats by categories.
一个功能申请stats按类别划分的子集，。


参数：...
Extra parameters passed to FUN.
额外的参数传递到FUN。


Details

详情----------Details----------

For GO categories, the function cateGOry might be useful for the construction of Amat.
我的类别，功能cateGOry可能是有用的Amat建设。


值----------Value----------

The return value is a list or vector of length equal to the number of categories. Each element corresponds to the values obtained by applying FUN to the subset of values in stats according to the category defined for that row.
返回值是一个列表或向量的长度等于类别数。每个元素对应申请FUN值的子集得到的值stats根据该行定义的类别。


作者（S）----------Author(s)----------


R. Gentleman, contributions from W. Huber



参见----------See Also----------

apply
apply


举例----------Examples----------


set.seed(0xabcd)
st = rnorm(20)
names(st) = paste("gene", 1:20)

a = matrix(sample(c(FALSE, TRUE), 60, replace=TRUE), nrow=3,
        dimnames = list(paste("category", LETTERS[1:3]), names(st)))

applyByCategory(st, a, median)

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