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R语言 CAMERA包 findNeutralLoss()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 14:04:04 | 显示全部楼层 |阅读模式
findNeutralLoss(CAMERA)
findNeutralLoss()所属R语言包:CAMERA

                                        Find pseudospectra that contains a specific neutral loss
                                         查找伪谱包含一个特定的中性丢失

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The method searches in every pseudospectra for a distance between two ions matching a provided mass difference. It returns a xcmsSet object containing the matching peaks.
在每两个匹配提供了质量差的离子之间的距离的伪谱方法搜索。它返回一个包含匹配峰xcmsSet对象。


用法----------Usage----------


  findNeutralLoss(object, mzdiff=NULL, mzabs=0, mzppm=10)



参数----------Arguments----------

参数:object
xsAnnotate object
xsAnnotate对象


参数:mzdiff
neutral loss in Dalton
在道尔顿的中性丢失


参数:mzabs
absolut allowed mass difference
绝对不允许质量差


参数:mzppm
relative allowed mass difference
相对允许质量差


Details

详情----------Details----------

The function needs a xsAnnotate object after groupCorr or groupFWHM. The resulting object is a artificial xcmsSet, where the peaks with the specific neutral loss are stored in xcmsSet@peaks.
该函数需要一个,后groupCorr或groupFWHM xsAnnotate对象。所产生的对象是一个的人工xcmsSet,存储与特定的中性丢失峰在xcmsSet @峰。


作者(S)----------Author(s)----------


Carsten Kuhl <ckuhl@ipb-halle.de>



举例----------Examples----------


  library(CAMERA)
  file <- system.file('mzdata/MM14.mzdata', package = "CAMERA")
  xs   <- xcmsSet(file, method="centWave", ppm=30, peakwidth=c(5,10))
  an   <- xsAnnotate(xs)
  an   <- groupFWHM(an)
  #Searches for Peaks with water loss[搜索失水峰]
  xs.pseudo <- findNeutralLoss(an,mzdiff=18.01,mzabs=0.01)
  xs.pseudo@peaks #show Hits[展示次数]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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