seqtreedisplay(TraMineR)
seqtreedisplay()所属R语言包:TraMineR
Graphical rendering of a sequence regression tree
图形渲染序列回归树
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Generate a graphical representation of a regression tree of state sequence data.
生成回归树的状态序列数据的图形化表示。
用法----------Usage----------
seqtreedisplay(tree, filename=NULL, seqdata=tree$info$object,
imgLeafOnly=FALSE, sortv=NULL, dist.matrix=NULL,
title.cex=3, withlegend="auto", legend.fontsize=title.cex,
axes=FALSE, imageformat="png", withquality=TRUE,
quality.fontsize=title.cex, legendtext=NULL,
showtree=TRUE, showdepth=FALSE, ...)
disstreedisplay(tree, filename=NULL, imagedata=NULL, imagefunc=plot,
imgLeafOnly=FALSE, title.cex=3, imageformat="png",
withquality=TRUE, quality.fontsize=title.cex,
legendtext=NULL, showtree=TRUE, showdepth=FALSE, ...)
参数----------Arguments----------
参数:tree
A seqtree object (as produced by seqtree).
Aseqtree的对象(产生的seqtree)。
参数:filename
The name of a file where to save the plot (overwritting existing file). If NULL, a temporary file is created.
一个文件,其中保存的的图(overwritting现有的文件)的名称。如果NULL,创建一个临时文件。
参数:seqdata
The sequence object containing the state sequences plotted in the nodes.
绘制的序列对象,其中包含的状态序列中的节点。
参数:imgLeafOnly
Logical. If TRUE sequences are plotted only in terminal nodes.
逻辑。如果TRUE序列绘制只有在终端节点。
参数:sortv
Argument passed to seqplot
参数传递给seqplot
参数:dist.matrix
Argument passed to seqplot
参数传递给seqplot
参数:title.cex
The cex value for the node titles (see par).
cex值的节点标题(见par“)。
参数:withlegend
Logical. Should the color legend be displayed on the plot?
逻辑。传奇的色彩显示上的图吗?
参数:legend.fontsize
Font cex value for the legend.
字体cex值的传说。
参数:axes
Argument passed to seqplot
参数传递给seqplot
参数:imageformat
Image format of the output file (filename)
图片格式的输出文件(filename)
参数:withquality
If TRUE, a node displaying fitting measures of the tree is added to the plot.
如果TRUE,显示拟合措施的树节点添加到图。
参数:quality.fontsize
Numeric. Size of the font of the fitting measures node.
数字。配合措施节点的字体大小。
参数:legendtext
Character. Optional text information that should be added.
字符。可选的文本信息,应予以补充。
参数:showtree
Logical. Should the tree be shown on the screen?
逻辑。如果树显示在屏幕上?
参数:showdepth
Logical. If TRUE, the splits are ordered according to their global pseudo-R2.
逻辑。如果TRUE,分割责令其全球的伪R2。
参数:imagefunc
A function to plot the individuals in a node, see details.
一个函数来绘制个人中的一个节点,查看详细信息。
参数:imagedata
a data.frame that will be passed to imagefunc.
data.frame将被传递给imagefunc。
参数:...
additional arguments passed to seqplot
额外的参数传递给seqplot
Details
详细信息----------Details----------
This function generates a tree image. For each node, it invokes seqplot for the selected lines of seqdata as argument. You should at least specify the type of the plot to use (type="d" for instance, see seqplot for more details).
这个函数生成一个树的图像。对于每个节点,它调用seqplot seqdata作为参数被选中的行。你至少应该指定type的图(type="d"例如,见seqplot更多详细信息)。
The plot is actually not generated as an R plot, but with GraphViz (www.graphviz.org). Hence, seqtreedisplay only works when GraphViz is correctly installed.
实际上,该图为R图,但用Graphviz(www.graphviz.org)。因此,seqtreedisplay只适用于GraphViz的正确安装。
Conversion to image formats other than "jpeg" or "png" is done using ImageMagick (www.imagemagick.org). To use this feature, ImageMagick (www.imagemagick.org) should hence also be installed.
“JPEG”或“PNG”以外的其他图像格式的转换是通过使用的ImageMagick(www.imagemagick.org)。要使用此功能,的ImageMagick(www.imagemagick.org)所以也可以安装。
值----------Value----------
None
无
参见----------See Also----------
See seqtree and disstree for examples, and disstree2dot for generating "dot" files.
见seqtree和disstree的例子,和disstree2dot产生“点”文件。
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