RG(CALIB)
RG()所属R语言包:CALIB
Experiment Data: RGList\_CALIB Example
实验数据:RGList \ _CALIB为例
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This RGList_CALIB object represents microarray data of two arrays.
这RGList_CALIB对象代表两个阵列芯片数据。
It is generated by function read.rg from raw data files.
它是由函数read.rg文件的原始数据。
用法----------Usage----------
data(RG)
格式----------Format----------
RG is an RGList_CALIB object containing the following list components: \$R,\$G,\$Rb,\$Gb,<br>\$RArea,\$GArea,\$targets,\$source and \$genes. It represents two microarrays and 19749 clones.
RG是RGList_CALIB对象,其中包含下面的列表组件:\ $ R,\~$ G \ $铷,\ $千兆,参考\ $ RArea,\ $ GArea \ $目标,源和\ $ \ $基因。它代表了两个芯片和19749克隆。
源----------Source----------
This comes from a publicly avaible dataset, consisting 14 hybridizations. From this RG, two out of these fourteen are chosen. The experiment design of these two are color flip. Except for cDNA probes, external control spikes are also spotted on the arrays. There are 192 ratio controls, 480 calibration controls,24 negative controls and 72 utility controls.
这是来自一个公开avaible集组成的14个杂交,。从这个RG,这十四选择。这两个实验的设计,颜色翻转。除cDNA探针,外部控制尖峰也发现阵列上。有192的比例控制,480个校准控制,24个阴性对照和72项实用。
For more information, see the reference.
有关详细信息,请参阅参考。
参考文献----------References----------
A calibration method for estimating absolute expression levels from microarray data. Bioinformatics 22: 1251-1258.
Arabidopsis functional genomics: transcript profiling and reverse genetics applications. Genome Res. 14, 2176-2189.
举例----------Examples----------
data(RG)
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