transLIN(TPmsm)
transLIN()所属R语言包:TPmsm
LIN based transition probabilities
LIN的转移概率
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Provides estimates for the transition probabilities based on LIN estimators, LIN.
提供的转移概率估计的基础上,LIN LIN估计。
用法----------Usage----------
state.names=c("1", "2", "3"), conf=FALSE, n.boot=1000, conf.level=0.95,
参数----------Arguments----------
参数:object
An object of class survTP.
对象的类survTP。
参数:s
The first time for obtaining estimates for the transition probabilities. If missing, 0 will be used.
第一时间获得的过渡概率的估计。如果缺少,0将被使用。
参数:t
The second time for obtaining estimates for the transition probabilities. If missing, the maximum of Stime will be used.
第二次获得的转移概率的估计。如果缺少,最大Stime将被使用。
参数:x
Covariate values for obtaining estimates for the conditional transition probabilities. If missing, unconditioned transition probabilities will be computed.
协方差获得有条件的转移概率的估计值。如果缺少,无条件转移概率计算。
参数:bw
A character string indicating a function to compute a kernel density or nearest-neighbor bandwidth. Defaults to "dpik" from package KernSmooth.
一个字符串,表示一个函数来计算内核密度和最近邻的带宽。默认为“dpik”包KernSmooth。
参数:window
A character string specifying the desired kernel or nearest-neighbor window. Defaults to "normal" where the gaussian density kernel will be used.
一个字符串,指定所需的内核或最近的邻居窗口。默认为“正常”的高斯密度内核将用来。
参数:method.weights
A character string specifying the desired weights method. Possible options are "NW" for the Nadaraya-Watson weights and "LL" for local linear weights. Defaults to "NW".
一个字符串,指定所需的权重方法。可能的选项是“NW”,为Nadaraya-沃特森的权重和当地线性权重的“LL”。默认为“NW”。
参数:state.names
A vector of characters giving the state names.
的矢量人物的状态名称。
参数:conf
Provides pointwise confidence bands. Defaults to FALSE.
提供逐点置信区间。默认为FALSE的。
参数:n.boot
The number of bootstrap samples. Defaults to 1000 samples.
bootstrap样本的数目。默认为1000个样本。
参数:conf.level
Level of confidence. Defaults to 0.95 (correponding to 95%).
水平的信心。默认为0.95(correponding至95%)。
参数:method.boot
The method used to compute bootstrap confidence bands. Possible options are "percentile" and "basic". Defaults to "percentile".
所使用的方法计算自举置信区间。可能的选项包括“百分”和“基本”。默认为“百分制”。
参数:...
Further arguments. Typically these arguments are passed to the function specified by argument bw.
进一步的论据。通常情况下,这些参数被传递给指定的函数参数bw。
值----------Value----------
If argument x is missing or if argument object doesn't contain a covariate, an object of class TPmsm is returned. There are methods for contour, image, print and plot. TPmsm objects are implemented as a list with elements:
如果参数x丢失或,如果参数object不包含协变量,对象类TPmsm则返回。的方法为contour,image,print和plot。 TPmsm对象被实现为与元素的列表:
参数:method
A string indicating the type of estimator used in the computation.
一个字符串,指示用于计算的估计。
参数:est
A matrix with transition probability estimates. The rows being the event times and the columns the 5 possible transitions.
转移概率矩阵估计。该行的事件时间和列的5个可能的转变。
参数:inf
A matrix with the lower transition probabilities of the confidence band. The rows being the event times and the columns the 5 possible transitions.
一个矩阵,转移概率较低的置信带。该行的事件时间和列的5个可能的转变。
参数:sup
A matrix with the upper transition probabilities of the confidence band. The rows being the event times and the columns the 5 possible transitions.
上的转移概率矩阵的信心带。该行的事件时间和列的5个可能的转变。
参数:time
Vector of times where the transition probabilities are computed.
次,其中的过渡概率计算的向量。
参数:s
Start of the time interval.
开始的时间间隔。
参数:t
End of the time interval.
结束的时间间隔。
参数:h
The bandwidth used. If the estimator doesn't require a bandwidth, it's set to NULL.
使用的带宽。如果估计并不需要的带宽,它被设置为NULL。
参数:state.names
A vector of characters giving the states names.
的矢量人物的状态名称。
参数:n.boot
Number of bootstrap samples used in the computation of the confidence band.
的计算中使用的信心频带bootstrap样本数目。
参数:conf.level
Level of confidence used to compute the confidence band.
的置信水平用于计算的置信带。
If argument x is specified and argument object contains a covariate, an object of class TPCmsm is returned. There are methods for print and plot. TPCmsm objects are implemented as a list with elements:
如果参数x指定参数object包含协变量,类的一个对象TPCmsm返回。有方法print和plot。 TPCmsm对象被实现为与元素的列表:
参数:method
A string indicating the type of estimator used in the computation.
一个字符串,指示用于计算的估计。
参数:est
A 3 dimentional array with transition probability estimates. The first dimension being the event times, the second the covariate values and the last one the 5 possible transitions.
A 3维数组,转移概率的估计。的第一尺寸的事件时间,所述第二协变量的值,最后一个的5个可能的转换。
参数:inf
A 3 dimensional array with the lower transition probabilities of the confidence band. The first dimension being the event times, the second the covariate values and the last one the 5 possible transitions.
A 3维数组的信心带的转移概率较低。的第一尺寸的事件时间,所述第二协变量的值,最后一个的5个可能的转换。
参数:sup
A 3 dimensional array with the upper transition probabilities of the confidence band. The first dimension being the event times, the second the covariate values and the last one the 5 possible transitions.
A 3维数组上转移概率的置信带。的第一尺寸的事件时间,所述第二协变量的值,最后一个的5个可能的转换。
参数:time
Vector of times where the transition probabilities are computed.
次,其中的过渡概率计算的向量。
参数:covariate
Vector of covariate values where the conditional transition probabilities are computed.
条件转移概率计算的协变量值的向量。
参数:s
Start of the time interval.
开始的时间间隔。
参数:t
End of the time interval.
结束的时间间隔。
参数:x
Additional covariate values where the conditional transition probabilities are computed, which may or may not be present in the sample.
额外的协变量的条件的过渡概率的计算的值,其中,这可能会或可能不会在存在于样品中。
参数:h
The bandwidth used.
使用的带宽。
参数:state.names
A vector of characters giving the states names.
的矢量人物的状态名称。
参数:n.boot
Number of bootstrap samples used in the computation of the confidence band.
的计算中使用的信心频带bootstrap样本数目。
参数:conf.level
Level of confidence used to compute the confidence band.
的置信水平用于计算的置信带。
(作者)----------Author(s)----------
Artur Agostinho Araujo, Javier Roca-Pardinas and Luis Meira Machado
参考文献----------References----------
参见----------See Also----------
transAJ, transIPCW, transKMPW, transKMW, transLS, transPAJ.
transAJ,transIPCW,transKMPW,transKMW,transLS,transPAJ。
实例----------Examples----------
# Create survTP object with age as covariate[创建survTP对象的年龄作为协变量]
data(heartTP)
heartTP_obj <- with(heartTP, survTP(time1, event1, Stime, event, age))
# Compute unconditioned transition probabilities[计算无条件的转移概率]
transLIN(object=heartTP_obj, s=33, t=412)
# Compute unconditioned transition probabilities with confidence band[计算的无条件转移概率与置信带]
transLIN(object=heartTP_obj, s=33, t=412, conf=TRUE, conf.level=0.9,
method.boot="basic")
# Compute conditional transition probabilities[计算条件转移概率]
transLIN(object=heartTP_obj, s=33, t=412, x=0)
# Compute conditional transition probabilities with confidence band[计算条件转移概率与置信带]
transLIN(object=heartTP_obj, s=33, t=412, x=0, conf=TRUE, conf.level=0.95,
method.boot="percentile")
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