R语言 biovizBase包 transformGRangesToDfWithTicks()函数中文帮助文档(中英文对照)

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transformGRangesToDfWithTicks(biovizBase)
transformGRangesToDfWithTicks()所属R语言包：biovizBase

                                        transformGRangesToDfWithTicks
                                         transformGRangesToDfWithTicks

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Transform GRanges object to a data.frame with ticks position stored in a list. This is different from simply coerce GRanges to a data frame, it is used for Grand Linear Compact View, which need to recompute the genomic coordinate and forcing them to be continued values.
格朗对象转换与存储在一个列表中的刻度线位置数据框。这是从简单要挟农庄，一个数据框不同，它是用于大线性契约观，需要重新计算基因组坐标，并迫使他们是持续的价值。


用法----------Usage----------


transformGRangesToDfWithTicks(gr, fixed.length = NULL)



参数----------Arguments----------

参数：gr
A GRanges object.  
一个农庄对象。


参数：fixed.length
Fixed length for arranging space. If NULL, use data range, which means it's simply concatenate the data based on seqnames. If it's provided, it's required that it's a numeric vector and names of the vector corresponding to the seqnames.  
固定长度的安排空间。如果为NULL，使用数据的范围，这意味着它只是串连基于对seqnames的数据。如果它提供的，它需要，它是一个数字向量和名称相应的seqnames的向量。


Details

详情----------Details----------

For compact grand linear view, we need to recompute the coordinates and concatenate them in a linear manner, remove the x axis labels and relabel them with chromosome names. So this function serve the basis for doing such transformation.
盛大的紧凑型线性视图，我们需要重新计算的坐标和线性的方式串连，删除X轴标签和重新标记染色体名。因此，此功能服务的基础上做这样的转型。


值----------Value----------

A list contains a data frame which with adjusted coordinates and a vector indicates the ticks position, which will be used for Grand Linear Compact View labeling in some graphics.
一个列表包含一个数据框，调整坐标和向量表示刻度线的位置，这将大线性紧凑视图标签在某些图形。


作者（S）----------Author(s)----------


Tengfei Yin



举例----------Examples----------


library(GenomicRanges)
gr <- GRanges("chr1", IRanges(seq(1,100, length.out = 10), width = 5))
transformGRangesToDfWithTicks(gr)

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