R语言 biovizBase包 getIdeogram()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

getIdeogram(biovizBase)
getIdeogram()所属R语言包：biovizBase

                                        Get ideogram.
                                         获取表意文字。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Get ideogram w/o cytoband for certain genome
表意文字/Øcytoband的某些基因


用法----------Usage----------





参数----------Arguments----------

参数：genome
Single specie names, which must be one of the result from ucscGenomes()$db. If missing, will invoke a menu for users to choose from.
单一的实物名称，必须是从ucscGenomes()$db的结果之一。如果丢失，会调用一个菜单供用户选择。


参数：subchr
A character vector used to subset the result.
使用一个特征向量的子集的结果。


参数：cytobands
If TRUE, return ideogram with gieStain and name column. If FALSE, simply return the genome information for each chromosome.
如果是TRUE，返回表意文字与gieStain和名称列。如果为FALSE，只是返回的每个染色体的基因组信息。


Details

详情----------Details----------

This function require a network connection, it will parse the data on the fly, function is a wrapper of some functionality from rtracklayer package to get certain table like cytoBand, a full table schema could be found http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTables in UCSC genome browser.This is useful for visualization of the whole genome or
此功能需要网络连接，它将解析动态的数据，功能是从rtracklayer包包装的一些功能得到像cytoBand一定表，全表架构可以发现http://genome.ucsc.edu/在UCSC基因组browser.This cgi-bin/hgTables是有用的可视化的全基因组或


值----------Value----------

A GRanges object.
一个农庄对象。


作者（S）----------Author(s)----------


Tengfei Yin



举例----------Examples----------


## Not run: hg19IdeogramCyto &lt;- getIdeogram("hg19", cytoband = TRUE)[＃无法运行：hg19IdeogramCyto < -  getIdeogram（“hg19”，cytoband = TRUE）]

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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