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R语言 Biostrings包 XStringViews-constructor()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 13:52:00 | 显示全部楼层 |阅读模式
XStringViews-constructor(Biostrings)
XStringViews-constructor()所属R语言包:Biostrings

                                        The XStringViews() constructor
                                         XStringViews()构造函数

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

WARNING: The XStringViews constructor function is deprecated!
警告:XStringViews构造函数已经过时了!

The XStringViews constructor function can be used for creating or modifying an XStringViews object.
XStringViews构造函数可用于创建或修改XStringViews的对象。


用法----------Usage----------


XStringViews(x, subjectClass, collapse="")



参数----------Arguments----------

参数:x
An XString object or a character vector for XStringViews.  
一个XString对象或为XStringViews的特征向量。


参数:subjectClass
The class to be given to the subject of the XStringViews object created and returned by the function. Must be the name of one of the direct XString subclasses i.e. "BString", "DNAString", "RNAString" or "AAString".  
给予的XStringViews对象的主题类创建的,由该函数返回。必须是其中一个直接XString子类的名称,即"BString","DNAString","RNAString"或"AAString"。


参数:collapse
An optional character string to be inserted between the views of the XStringViews object created and returned by the function.  
一个可选的字符串之间插入创建和函数返回的XStringViews对象的意见。


Details

详情----------Details----------

The XStringViews constructor will try to create an XStringViews object from the value passed to its x argument. If x itself is an XStringViews object, the returned object is obtained by coercing its subject to the class specified by subjectClass. If x is an XString object, the returned object is made of a single view that starts at the first letter and ends at the last letter of x (in addition x itself is coerced to the class specified by subjectClass when specified). If x is a character vector, the returned object has one view per character string in x (and its subject is an instance of the class specified by subjectClass).
XStringViews构造将尝试创建一个XStringViews对象的值传递给它的x参数。如果x本身就是一个XStringViews对象,返回的对象是通过强迫其受指定的类subjectClass。如果x是XString的对象,返回的对象的第一个字母开始和结束的最后一个字母x(除了一个单一的视图x本身是强迫类subjectClass指定时)指定的。 x如果是一个字符向量,返回对象的每一个字符串x(其主体是一个由subjectClass指定的类的实例)。


值----------Value----------

An XStringViews object y. length(y) (the number of views in y) is 1 when x is an XString object and length(x) otherwise.
一个XStringViews对象y。 length(y)(意见y的数字)是1当x是XString的对象和length(x)否则。


参见----------See Also----------

XStringViews-class, XStringSet-class, XString-class
XStringViews类,XStringSet一流的,XString级


举例----------Examples----------


v12 <- Views(DNAString("TAATAATG"), start=-2:9, end=0:11)

## Do not do this anymore:[#不要再这样做了:]
if (interactive()) {
  XStringViews(v12, subjectClass="RNAString")  # DEPRECATED![不推荐!]
}
## Do this instead:[#而不是:]
xsbasetype(v12) <- "RNA"

## Do not do this anymore:[#不要再这样做了:]
if (interactive()) {
  XStringViews(AAString("MARKSLEMSIR*"))  # DEPRECATED![不推荐!]
}
## Do this instead:[#而不是:]
as(AAString("MARKSLEMSIR*"), "Views")

x <- c("abcdefghij", "KLMN")
## Do not do this anymore:[#不要再这样做了:]
if (interactive()) {
  XStringViews(x, subjectClass="BString")  # DEPRECATED![不推荐!]
}
## Do this instead (if you really want views):[#这样做(如果你真的想要意见):]
as(BStringSet(x), "Views")
## otherwise just do:[#否则只是做:]
BStringSet(x)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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