R语言 Biostrings包 chartr()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

chartr(Biostrings)
chartr()所属R语言包：Biostrings

                                        Translating letters of a sequence
                                         翻译信件的序列

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Translate letters of a sequence.
转换序列的字母。


用法----------Usage----------


## S4 method for signature 'ANY,ANY,XString'
chartr(old, new, x)



参数----------Arguments----------

参数：old
A character string specifying the characters to be translated.  
一个字符串指定的字符被翻译。


参数：new
A character string specifying the translations.  
一个字符串指定的翻译。


参数：x
The sequence or set of sequences to translate. If x is an XString, XStringSet, XStringViews or MaskedXString object, then the appropriate chartr method is called, otherwise the standard chartr R function is called.  
翻译组序列或序列。如果x是XString的，XStringSet，XStringViews或MaskedXString的对象，然后在适当的被称为chartr方法，否则标准的chartrR的功能被称为。


Details

详情----------Details----------

See ?chartr for the details.
看到?chartr细节。

Note that, unlike the standard chartr R function, the methods for XString, XStringSet, XStringViews and MaskedXString objects do NOT support character ranges in the specifications.
请注意，不像标准的chartrR的功能，为XString，XStringSet，XStringViews和MaskedXString对象的方法，不支持在规范的字符范围。


值----------Value----------

An object of the same class and length as the original object.
同一类的对象和原始对象的长度。


参见----------See Also----------

chartr, replaceLetterAt, XString-class, XStringSet-class, XStringViews-class, MaskedXString-class, alphabetFrequency, matchPattern, reverseComplement
chartr，replaceLetterAt，级XStringViews，级XStringSet，XString-级，级MaskedXString，alphabetFrequency，matchPattern，reverseComplement


举例----------Examples----------


  x <- BString("MiXeD cAsE 123")
  chartr("iXs", "why", x)

  ## ---------------------------------------------------------------------[＃------------------------------------------------- --------------------]
  ## TRANSFORMING DNA WITH BISULFITE (AND SEARCHING IT...)[＃转化的DNA与亚硫酸氢钠（与搜索...）]
  ## ---------------------------------------------------------------------[＃------------------------------------------------- --------------------]

  library(BSgenome.Celegans.UCSC.ce2)
  chrII <- Celegans[["chrII"]]
  alphabetFrequency(chrII)
  pattern <- DNAString("TGGGTGTATTTA")

  ## Transforming and searching the + strand[＃转化和搜索+链]
  plus_strand <- chartr("C", "T", chrII)
  alphabetFrequency(plus_strand)
  matchPattern(pattern, plus_strand)
  matchPattern(pattern, chrII)

  ## Transforming and searching the - strand[＃转化和搜索 - 链]
  minus_strand <- chartr("G", "A", chrII)
  alphabetFrequency(minus_strand)
  matchPattern(reverseComplement(pattern), minus_strand)
  matchPattern(reverseComplement(pattern), chrII)

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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