R语言 BioNet包 scoreNodes()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

scoreNodes(BioNet)
scoreNodes()所属R语言包：BioNet

                                        Score the nodes of a network
                                         取得网络节点

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The function derives scores from the p-values of the nodes of a network.
来自网络节点的P-值函数的分数。


用法----------Usage----------


scoreNodes(network, fb, fdr=0.05)



参数----------Arguments----------

参数：network
A network in graphNEL or igraph format.
在graphNEL或IGRAPH格式网络。


参数：fb
Fitted bum model.
合身烧伤模型。


参数：fdr
False discovery rate.
虚假的发现率。


值----------Value----------

Ordered score vector for the nodes of the network.
得分向量有序的网络节点。


作者（S）----------Author(s)----------


Marcus Dittrich



参见----------See Also----------

bumOptim, fitBumModel
bumOptim，fitBumModel


举例----------Examples----------


library(DLBCL)
# load p-values[加载p-值]
data(dataLym)
# load graph[负载图]
data(interactome)
# get induced subnetwork for all genes contained on the chip[在芯片上包含的所有基因诱导子网]
chipGraph <- subNetwork(dataLym$label, interactome)
p.values <- dataLym$t.pval
names(p.values) <- dataLym$label
bum <- fitBumModel(p.values, plot=TRUE)
scoreNodes(network=chipGraph, fb=bum, fdr=0.001)

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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