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R语言 BioNet包 scoreFunction()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 13:39:53 | 显示全部楼层 |阅读模式
scoreFunction(BioNet)
scoreFunction()所属R语言包:BioNet

                                         Scoring function for p-values
                                         p值的打分函数

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The function calculates a score for each gene with a given FDR from the fitted beta-uniform mixture model.
函数计算每个基因从一个给定的FDR拟合β-均匀混合模型的得分。


用法----------Usage----------


scoreFunction(fb, fdr=0.01)



参数----------Arguments----------

参数:fb
Model from the beta-uniform mixture fitting.  
从β-均匀混合拟合模型。


参数:fdr
Numeric constant, from the false discovery rate a p-value threshold is calculated. P-values below this threshold are considered to be significant and will score positively, p-values a bove the threshold are supposed to arise from the null model. The FDR can be used to control the size of the maximum scoring subnetwork, by zooming in and out  in the same region.  
数字常量,从虚假的发现率,p值阈值计算。 P值低于这个阈值被认为是重要的,一定会取得积极,P值的阈值应该出现空模型波夫。FDR可以被用来控制最高得分子网的大小,在同一区域和放大。


值----------Value----------

Score vector for the given p-values.
对于给定的P-值的得分向量。


作者(S)----------Author(s)----------



Marcus Dittrich and Daniela Beisser




参考文献----------References----------



举例----------Examples----------


data(pvaluesExample)
pvals <- pvaluesExample[,1]
bum.mle <- fitBumModel(pvals, plot=FALSE)
scores <- scoreFunction(fdr=0.1, fb=bum.mle)
scores

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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