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R语言 BioNet包 loadNetwork.sif()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 13:37:33 | 显示全部楼层 |阅读模式
loadNetwork.sif(BioNet)
loadNetwork.sif()所属R语言包:BioNet

                                         Load network from Cytoscape sif file
                                         从Cytoscape的SIF文件加载网络

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The function loads a network from a Cytoscape sif file. Edge attributes are provided in the ea.file or vector of ea.files. The node attributes are provided the same way.  For other formats see read.graph in the igraph package.
从Cytoscape的sif文件的功能加载网络。边缘属性提供的ea.file或ea.files的向量。节点的属性都提供相同的方式。对于其他格式看到在IGRAPH包的read.graph。


用法----------Usage----------


loadNetwork.sif(sif.file, na.file, ea.file, format=c("graphNEL", "igraph"), directed=FALSE)



参数----------Arguments----------

参数:sif.file
Cytoscape sif file, containing the network.  
Cytoscape的SIF文件,其中包含网络。


参数:na.file
File or vector of file with Cytoscape node attibutes.   
Cytoscape的节点attibutes的文件或文件向量。


参数:ea.file
File or vector of file with Cytoscape edge attibutes.   
Cytoscape的边缘attibutes文件的文件或矢量。


参数:format
Format of output graph, either graphNEL or igraph.  
输出图形的格式,要么graphNEL或IGRAPH。


参数:directed
Boolean value for directed or undirected graph.  
布尔值,指示或无向图。


值----------Value----------

Graph with loaded attributes.
图与装属性。


作者(S)----------Author(s)----------



Daniela Beisser




举例----------Examples----------


## Not run: lib &lt;- file.path(.path.package("BioNet"), "extdata") [#无法运行库< -  file.path(path.package(“生物网”),“extdata”)]
# load interaction file, node attribute file with a node weight of 2 for each node and the edge attribute file with a edge weight of 1 for each edge[负载的相互作用文件,每个节点和边缘属性文件为每边1边的权重为2的节点重量节点属性文件]
network <- loadNetwork.sif(sif.file=file.path(lib,"cytoscape.sif"), na.file=file.path(lib,"n.weight.NA"), ea.file=file.path(lib,"weight.EA"), format="graphNEL", directed=FALSE);
network;
nodeData(network);
edgeData(network);

## End(Not run)[#结束(不运行)]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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