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R语言 biomaRt包 listAttributes()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 13:34:31 | 显示全部楼层 |阅读模式
listAttributes(biomaRt)
listAttributes()所属R语言包:biomaRt

                                        lists the attributes available in the selected dataset
                                         列出可用的属性,在选定的数据集

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Attributes are the outputs of a biomaRt query, they are the information we want to retrieve.  For example if we want to retrieve all entrez gene identifiers of genes located on chromosome X, entrezgene will be the attribute we use in the query.  The listAttributes function lists the available attributes in the selected dataset
属性是一个biomaRt查询的输出,他们是我们要检索的信息。例如,如果我们想检索Entrez基因位于X染色体上基因的所有标识符,entrezgene将是我们在查询中使用的属性。 listAttributes功能列出可用的属性,在选定的数据集


用法----------Usage----------


listAttributes(mart, page,what = c("name","description"), group, category, showGroups = FALSE)



参数----------Arguments----------

参数:mart
object of class Mart created using the useMart function
沃尔玛类的对象创建使用useMart功能


参数:page
Show only the attributes that belong to the specified attribute page.
只显示属于指定的属性页的属性。


参数:what
vector of types of information about the attributes that need to be displayed.  Can have values like name, description, fullDescription, page
向量的属性,需要显示的信息类型。可以有值,如名称,描述,fullDescription页


参数:group
Availability of group argument is pending on availability from BioMart web service.  Currently this argument can not be used
组参数的可用性有待从BioMart Web服务的可用性。目前,这种说法不能使用


参数:category
Category is now replaced by page to better comply with the BioMart suite http://www.biomart.org
分类正在取代页,以更好地遵守的BioMart套房http://www.biomart.org


参数:showGroups
Availability of showGroups argument is pending on availability from BioMart web service.  Currently this argument can not be used
可用性showGroups参数是待从BioMart Web服务的可用性。目前,这种说法不能使用


作者(S)----------Author(s)----------


Steffen Durinck



举例----------Examples----------



if(interactive()){
ensembl = useMart("ensembl", dataset="hsapiens_gene_ensembl")
listAttributes(ensembl)
}

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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