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R语言 biomaRt包 exportFASTA()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 13:33:14 | 显示全部楼层 |阅读模式
exportFASTA(biomaRt)
exportFASTA()所属R语言包:biomaRt

                                        Exports getSequence results to FASTA format
                                         出口某个getSequence结果FASTA格式

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Exports getSequence results to FASTA format
出口某个getSequence结果FASTA格式


用法----------Usage----------


exportFASTA(sequences, file)



参数----------Arguments----------

参数:sequences
A data.frame that was the output of the getSequence function
是的某个getSequence函数的输出数据框


参数:file
File to which you want to write the data
文件您想要将数据写入


作者(S)----------Author(s)----------


Steffen Durinck



举例----------Examples----------



if(interactive()){
mart <- useMart("ensembl", dataset="hsapiens_gene_ensembl")

#seq&lt;-getSequence(chromosome=c(2,2),start=c(100000,30000),end=c(100300,30500),mart=mart)[SEQ <方式某个getSequence(染色体= C(2,2),开始= C(100000,30000),结束= C(100300,30500),集市集市)]
#exportFASTA(seq,file="test.fasta")[exportFASTA(SEQ,文件“test.fasta”的)]

martDisconnect(mart = mart)
}

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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