R语言 bioDist包 mutualInfo()函数中文帮助文档(中英文对照)

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mutualInfo(bioDist)
mutualInfo()所属R语言包：bioDist

                                        Mutual Information
                                         互信息

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Calculate mutual information via binning
通过分级计算互信息


用法----------Usage----------


mutualInfo(x, ...)
MIdist(x, ...)



参数----------Arguments----------

参数：x
an n by p matrix or ExpressionSet; if x is an ExpressionSet, then the function uses its 'exprs' slot.
由p矩阵或ExpressionSet的N;如果x是一个ExpressionSet，那么该函数使用其exprs“槽。


参数：...
arguments passed to mutualInfo and MIdist:   
参数传递给mutualInfo和MIdist：

nbinnumber of bins to calculate discrete probabilities; default is 10.   
箱nbinnumber，计算离散概率;默认为10。

diagif TRUE, then the diagonal of the distance matrix will be displayed; default is FALSE.   
真diagif，然后在距离矩阵的对角线将显示，默认为false。

upperif TRUE, then the upper triangle of the distance matrix will be displayed; default is FALSE.   
upperif为TRUE，然后在距离矩阵的上三角将显示默认为false。

samplefor ExpressionSet methods, if TRUE, then distances are computed between samples, otherwise, between genes.     
samplefor ExpressionSet方法，如果属实，那么距离计算样本之间，否则，基因之间。


Details

详情----------Details----------

For mutualInfo each row of x is divided into  nbin groups and then the mutual information is computed, treating  the data as if they were discrete.
mutualInfo每行xnbin组，然后分为互信息的计算，处理的数据，如果他们离散。

For MIdist we use the transformation proposed by Joe (1989), delta* = (1 - exp(-2 delta))^.5 where delta is the mutual information. The MIdist is  then 1-delta*. Joe argues that this measure is then  similar to Kendall's tau, tau.dist.
MIdist我们使用由乔（1989）所提出的转型，delta* = (1 - exp(-2 delta))^.5其中delta是相互的信息。 MIdist是然后1-delta*的。乔认为，这项措施是Kendall的头，然后类似tau.dist。


值----------Value----------

An object of class dist which contains the pairwise distances.
一个对象类dist其中包含成对的距离。


作者（S）----------Author(s)----------


Robert Gentleman



参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

dist, KLdist.matrix,
dist，KLdist.matrix


举例----------Examples----------


x <- matrix(rnorm(100), nrow = 5)
mutualInfo(x, nbin = 3)

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