R语言 Biobase包 createPackage()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

createPackage(Biobase)
createPackage()所属R语言包：Biobase

                                        Create a Package Directory from a Template
                                         从模板创建包目录

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Create a package directory from a template, with symbol-value substitution
从模板创建一个包目录，符号值替换


用法----------Usage----------


createPackage(pkgname, destinationDir, originDir, symbolValues, unlink=FALSE, quiet=FALSE)



参数----------Arguments----------

参数：pkgname
Character. The name of the package to be written.
字符。要写入的包的名称。


参数：destinationDir
Character. The path to a directory where the package is to be written.
字符。包是被写入到一个目录的路径。


参数：originDir
Character. The path to a directory that contains the template package. Usually, this will contain a file named DESCRIPTION, and subdirectories R, man, data. In all files and filenames, symbols will be replaced by their respective values, see the parameter symbolValues.
字符。模板包到一个目录，其中包含的路径。通常情况下，这将包含一个文件名为DESCRIPTION和子目录R，man，data。中的所有文件和文件名，符号将取代它们各自的值，参数symbolValues。


参数：symbolValues
Named list of character strings. The symbol-to-value mapping. See copySubstitute for details.
命名的字符串列表。符号值映射。看到copySubstitute详情。


参数：unlink
Logical. If TRUE, and destinationDir already contains a file or directory with the name pkgname, try to unlink (remove) it.
逻辑。如果TRUE，destinationDir已经包含一个文件或目录的名称pkgname，尝试的unlink（删除）。


参数：quiet
Logical. If TRUE, do not print information messages.
逻辑。如果TRUE，不打印信息的消息。


Details

详情----------Details----------

The intended use of this function is for the automated mass production of data packages, such as the microarray annotation, CDF, and probe sequence packages.
这个函数的使用目的是如芯片注释，民防部队和探针序列包，数据包的自动化批量生产。

No syntactic or other checking of the package is performed. For this, use R CMD check.
没有包的句法或其他检查。对于这一点，使用R加利福尼亚检查。

The symbols @PKGNAME@ and @DATE@ are automatically defined with the values of pkgname and date(), respectively.
符号@PKGNAME@和@DATE@自动定义值pkgname和date()，分别。


值----------Value----------

The function returns a list with one element pkgdir: the path to the package.
该函数返回一个一个元素listpkgdir：包的路径。


作者（S）----------Author(s)----------


Wolfgang Huber <a href="http://www.dkfz.de/mga/whuber">http://www.dkfz.de/mga/whuber</a>



参见----------See Also----------

copySubstitute,
copySubstitute


举例----------Examples----------


  sym  = list(AUTHOR = "Hesiod", VERSION = "1.0",
         TITLE = "the nine muses",
         FORMAT = "Character vector containg the names of the 9 muses.")

  res  = createPackage("muses",
           destinationDir = tempdir(),
           originDir      = system.file("Code", package="Biobase"),
           symbolValues   = sym,
           unlink = TRUE, quiet = FALSE)

  muses = c("Calliope", "Clio", "Erato", "Euterpe", "Melpomene",
            "Polyhymnia", "Terpsichore", "Thalia", "Urania")

  dir.create(file.path(res$pkgdir, "data"))

  save(muses, file = file.path(res$pkgdir, "data", "muses.rda"))

  res$pkgdir

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