plotBasic(BGmix)
plotBasic()所属R语言包：BGmix
Basic plots of BGmix parameters and data.
BGmix参数和数据的基本图。
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Plots gene effects and variances versus their corresponding data sufficient statistics (to show the effect of smoothing and shrinkage). Also plots "volcano plots": posterior probabilities of being classified in each mixture component versus the log fold change parameters.
图的基因效应和方差与相应的数据（显示平滑和收缩的影响）足够的统计相比。也图“火山图”：被归类在每个混合组件与log倍的变化参数的后验概率。
用法----------Usage----------
plotBasic(res, ybar, ss, q.mean = T, q.diff = T, q.sig = T, q.volcano = T)
参数----------Arguments----------
参数：res
list object output from 'ccParams'
列表对象输出从ccParams
参数：ybar
ybar data (see BGmix help for details)
ybar数据（见详情BGmix帮助）
参数：ss
ss data (see BGmix help for details)
SS的数据（见详情BGmix帮助）
参数：q.mean
logical. Include mean plot?
逻辑。包括平均图？
参数：q.diff
logical. Include log fold change plot?
逻辑。包括log倍图？
参数：q.sig
logical. Include variance plot?
逻辑。包括方差图吗？
参数：q.volcano
logical. Include volcana plot (posterior classification v. fold change)?
逻辑。包括volcana图（后分类诉倍）？
Details
详情----------Details----------
Note this plotting function is designed for model output from the unpaired differential expression design.
注意：此绘图功能是为未成差异表达设计的模式，从输出设计。
值----------Value----------
No value is returned to R. Results from BGmix model are output to files.
没有返回值从BGmix模型R.的结果输出到文件。
作者（S）----------Author(s)----------
Alex Lewin
举例----------Examples----------
## Note this is a very short MCMC run![＃注意：这是一个很短的MCMC运行！]
## For good analysis need proper burn-in period.[＃为了获得良好的分析，需要适当的老化期。]
data(ybar,ss)
outdir <- BGmix(ybar, ss, c(8,8), nburn=0, niter=100, nthin=1)
params <- ccParams(outdir)
plotBasic(params,ybar,ss)
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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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发表于 2012-2-25 13:13:24
