R语言 bgafun包 top_residues_2_groups()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

top_residues_2_groups(bgafun)
top_residues_2_groups()所属R语言包：bgafun

                                         Return a list of the top residues at either end of the axis
                                         在轴的两端返回顶端残留的列表

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This will identify the residues that are most discriminating between the two groups, and as such are most likely to be specifity determining resdius It will return a list of the residues at the end of the axis in a bga analysis. It is used when there are two groups.  The function create\_profile\_strings can be  used to look at the amino acid content in the column that the analysis identifies
这将确定两组间的残留物，是最挑剔的，是最有可能的特异性决定resdius，它会返回在BGA分析轴的残留物列表。它是用来当有两组。该函数创建\ \ _strings可用于氨基酸含量分析确定在列_profile


用法----------Usage----------


top_residues_2_groups(bga_results,residue_number=20)



参数----------Arguments----------

参数：bga_results
Results of BGA analysis, either from BGA or run\_between\_pca function   
BGA的分析结果，无论是从BGA或运行\ _between \ _pca功能


参数：residue_number
Number of positions at each end of the axis to return  
在轴两端的职位数量返回


举例----------Examples----------


library(bgafun)
data(LDH.groups)
data(LDH.amino.gapless)
LDH.binary.bga=bga(t(LDH.amino.gapless+1),LDH.groups)
top_res=top_residues_2_groups(LDH.binary.bga)
#To tidy up the results[清理结果]
names(top_res)=sub("X","",names(top_res))
# to look at the amino acid content in the alignment [看氨基酸含量的对齐]
LDH.profiles=create_profile_strings(LDH.amino.gapless,LDH.groups)
LDH.profiles[, colnames(LDH.profiles) %in% names(top_res)]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。