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R语言 bgafun包 convert_aln_amino()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 13:09:06 | 显示全部楼层 |阅读模式
convert_aln_amino(bgafun)
convert_aln_amino()所属R语言包:bgafun

                                         Converts an alignment object into binary amino matrix
                                         对齐对象转换成二进制氨基酸矩阵

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Converts an alignment object, read in by the seqinr package, into a binary matrix. The binary matrix represents the absence or presence of amino acids at each position in the alignment
读由seqinr包,对齐对象,转换成二进制矩阵。二进制矩阵表示对齐在每个位置的情况下或存在的氨基酸


用法----------Usage----------


convert_aln_amino(Alignment)



参数----------Arguments----------

参数:Alignment
Alignment object read in using read.alignment function in seqinr  
读在使用在seqinr read.alignment功能对齐对象


举例----------Examples----------


library(bgafun)
LDH <- read.alignment(file = system.file("sequences/LDH-MDH-PF00056.fasta", package = "bgafun"), format = "fasta")
LDH.amino=convert_aln_amino(LDH)
dim(LDH.amino)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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