showArrayMask(beadarray)
showArrayMask()所属R语言包:beadarray
Show Array Mask
显示阵列面膜
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Function to display beads masked by BASH. The masked beads are assumed to have a weight of 0 in the specified weights column.
函数来显示由bash屏蔽珠。蒙面珠认为,必须在指定的权重列重量为0。
用法----------Usage----------
showArrayMask(BLData,array = 0, override = FALSE, wtsName = "wts", transFun = logGreenChannelTransform, outlierFun = illuminaOutlierMethod, horizontal=TRUE)
参数----------Arguments----------
参数:BLData
A BeadLevelList object.
一个BeadLevelList对象。
参数:override
Logical. Plotting a large mask can cause slowdown problems. By default, if more than 200 000 beads are masked, the current mask will not be plotted. You can force the mask to be plotted by setting this argument to TRUE, however beware as this may cause slower systems to freeze.
逻辑。绘制一个大口罩,可能会导致经济放缓的问题。默认情况下,如果超过200万珠被屏蔽,不会被绘制当前的面具。您可以强制通过设置这个参数TRUE绘制的面具,但要小心,因为这可能会导致较慢的系统冻结。
参数:wtsName
name under which the bead weights are stored
名珠的重量存储
参数:array
numeric index of the array to plot
数字索引数组图
参数:transFun
function to transform intensities prior to calculating outliers
功能转换前强度计算离群
参数:outlierFun
function to remove outliers
功能,以消除离群
参数:horizontal
if TRUE the resulting image is plotting with the longest edge along the x axis
如果真实的图像绘制沿x轴的最长边
Details
详情----------Details----------
showArrayMask plots the beads on an array that have been assigned a weight of 0 by BASH in red, and beads determined to be outliers in black.
showArrayMask图已分配由bash红色,并确定为离群黑色的珠重量为0的阵列上的珠子。
值----------Value----------
None returned
没有返回
作者(S)----------Author(s)----------
Jonathan Cairns and Mark Dunning
举例----------Examples----------
if(require(beadarrayExampleData)){
data(exampleBLData)
showArrayMask(exampleBLData,2)
}
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