R语言 spider包 sppDist()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

sppDist(spider)
sppDist()所属R语言包：spider

                                        Intra and inter-specific distances
                                         内和种间的距离

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Separates a distance matrix into its inter- and intra-specific components.
分隔的距离矩阵间和种内的组件。


用法----------Usage----------


sppDist(distobj, sppVector)



参数----------Arguments----------

参数：distobj
A distance matrix.  
距离矩阵。


参数：sppVector
The species vector (see sppVector).  
种矢量（见sppVector“）。


Details

详细信息----------Details----------

This function can be used to produce histograms and other charts exploring the "barcode gap", such as in the examples below.
直方图和其他图表探索“条形码差距，如在下面的例子中，可以使用此功能。


值----------Value----------

A list with two elements:
有两个元素的列表：


参数：inter
A numeric vector containing ALL inter-specific pairwise distances.
一个数字向量间的所有特定的成对距离。


参数：intra
A numeric vector containing ALL intra-specific pairwise distances.
一个数值向量，包含所有内特定的成对距离。


（作者）----------Author(s)----------



Samuel Brown <s_d_j_brown@hotmail.com>




参见----------See Also----------

sppDistMatrix.
sppDistMatrix。


实例----------Examples----------


data(dolomedes)
doloDist <- dist.dna(dolomedes)
doloSpp <- substr(dimnames(dolomedes)[[1]], 1, 5)

doloSpDist <- sppDist(doloDist, doloSpp)

doloSpDist

#Histogram of the barcode gap[直方图的条码差距]
transGreen &lt;- rgb(0, 1, 0, 0.5) #Make a slightly transparent colour to see some overlap[做一个稍微透明的颜色，看到一些重叠]
hist(doloSpDist$inter, col="grey")
hist(doloSpDist$intra, col=transGreen, add=TRUE)

#Boxplot of the same[箱线图相同]
boxplot(doloSpDist)

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
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