seqStat(spider)
seqStat()所属R语言包:spider
Sequence statistics
序列统计
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Utility that produces a table giving summary statistics for a "DNAbin" object.
实用程序产生的“DNAbin对象表,汇总统计数据。
用法----------Usage----------
seqStat(DNAbin, thresh)
参数----------Arguments----------
参数:DNAbin
Alignment of class "DNAbin".
对准的类的DNAbin“。
参数:thresh
Threshold sequence length. Default of 500 (minimum length for official DNA barcodes).
阈值的序列长度。默认为500(最小长度为官方DNA条形码)。
Details
详细信息----------Details----------
This function considers bases coded as '?', 'N' and '-' as missing data.
此功能考虑基础编码为?,N和 - 丢失的数据。
值----------Value----------
A table giving the minimum, maximum, mean and median sequence lengths, and the number of sequences with lengths below the given threshold.
的表给出的最小值,最大值,平均值和中位数的序列长度,和低于给定的阈值的长度的序列的数目。
(作者)----------Author(s)----------
Rupert Collins <rupertcollins@gmail.com>
实例----------Examples----------
data(anoteropsis)
seqStat(anoteropsis)
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
|