R语言 spider包 nucDiag()函数中文帮助文档(中英文对照)

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nucDiag(spider)
nucDiag()所属R语言包：spider

                                         Nucleotide diagnostics for species alignments
                                         核酸诊断的物种比对

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Determines the diagnostic nucleotides for each species given in sppVector.
确定诊断核苷酸的每一个物种在sppVector。


用法----------Usage----------


nucDiag(DNAbin, sppVector)



参数----------Arguments----------

参数：DNAbin
An object of class 'DNAbin'.  
对象类的DNAbin。


参数：sppVector
The species vector (see sppVector).  
种矢量（见sppVector“）。


值----------Value----------

A list giving the pure, simple diagnostic nucleotides (i.e. those nucleotides that are fixed within species and different from all other species) for each species in the species vector. A result of integer(0) indicates there are no diagnostic nucleotides for those species.
列表纯粹的，简单的诊断核苷酸（即核苷酸被固定在与所有其他物种的种类和不同），每个物种的物种矢量。 integer(0)的一个结果表明这些物种有没有诊断的核苷酸。


（作者）----------Author(s)----------



Samuel Brown <s_d_j_brown@hotmail.com>




参考文献----------References----------

based DNA barcoding. _Molecular Ecology Resources_ *8* 1256-1259

参见----------See Also----------

slideNucDiag
slideNucDiag


实例----------Examples----------


data(anoteropsis)
anoSpp <- sapply(strsplit(dimnames(anoteropsis)[[1]], split="_"),
        function(x) paste(x[1], x[2], sep="_"))

nucDiag(anoteropsis, anoSpp)

#To view the nucleotide values [要查看核苷酸值]
anoNuc <- nucDiag(anoteropsis, anoSpp)
as.character(anoteropsis[ ,anoNuc[[1]][1] ])


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