R语言 spider包 checkDNA()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

checkDNA(spider)
checkDNA()所属R语言包：spider

                                        Check a DNA alignment for missing data
                                         查看DNA丢失的数据对齐

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This functions counts the number of bases in an alignment that are composed of missing data.
此功能的碱基的数量进行计数，在丢失的数据所组成的取向。


用法----------Usage----------


checkDNA(DNAbin, gapsAsMissing = TRUE)



参数----------Arguments----------

参数：DNAbin
A DNA alignment of class "DNAbin".
一个DNA对准类的DNAbin“。


参数：gapsAsMissing
Logical. Should gaps (coded as '-') be considered missing bases? Default of TRUE.
逻辑。如果间隙（编码为“ - ”）被认为是缺少的碱基呢？默认值为TRUE。


Details

详细信息----------Details----------

This function considers bases coded as '?' and 'N' as missing data. By default, gaps (coded as '-') are also considered missing.
此函数认为碱基编码为？ N为缺失数据。默认情况下，的差距（编码为“ - ”）也被认为是失踪。


值----------Value----------

A numeric vector giving the number of missing bases in each sequence of the alignment.
一个数字矢量缺少的排列顺序，在每个碱基的数量。


（作者）----------Author(s)----------



Samuel Brown <s_d_j_brown@hotmail.com>




实例----------Examples----------


data(anoteropsis)
checkDNA(anoteropsis)
checkDNA(anoteropsis, gapsAsMissing=FALSE)

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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