R语言 beadarray包 poscontPlot()函数中文帮助文档(中英文对照)

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poscontPlot(beadarray)
poscontPlot()所属R语言包：beadarray

                                         Plot the positive controls
                                         绘制的阳性对照

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Function for retrieving and plotting the biotin and housekeeping controls for an expression array. We know these controls should show high signal and are therefore useful for QA purposes. The housekeeping control targets a bead-type believed to be universally expressed whereas the biotin control targets the biotin used for staining.
检索和绘图表达阵列的生物素和内部管理控制功能。我们知道这些控制应表现出较高的信号，并因此为质保目的有用。管家的控制目标相信得到普遍的表达，而生物素控制目标染色用生物素珠型。


用法----------Usage----------


poscontPlot(BLData, array = 1, transFun = logGreenChannelTransform, positiveControlTags = c("housekeeping", "biotin"), colList = c("red", "blue"), controlProfile = NULL, ...)



参数----------Arguments----------

参数：BLData
a beadLevelData object  
beadLevelData对象


参数：array
The section to be plotted  
要绘制的部分


参数：transFun
What transformation function to be applied prior to plotting  
变换函数之前被应用到策划


参数：positiveControlTags
What identifiers to be used as positive controls  
作为阳性对照使用什么标识符


参数：colList
vector of colours to be used to each positive control  
可用于每个阳性对照颜色矢量


参数：controlProfile
an optional data frame with columns defining the ArrayAddress IDs and control\-type for all controls on the platform.  
列定义ArrayAddress ID和控制平台上的所有控件\型可选的数据框。


参数：...
other arguments to plot  
其他参数绘制


Details

详情----------Details----------

Function for plotting the observed intensites for all replicates of the specified control probes on a given array\-section. The identity of the control probes can be specified by passing a ControlProfile data frame, with the first column being a vector of ArrayAddress IDs and the second column being a corresponding set of characters tags. The beads to be plotted are found by matching the positiveControlTags argument to these character tags.  Users with expression data can have the ControlProfile data frame defining automatically within the function, provided the annotation of the beadLevelData object has been defined by readIllumina or setAnnotation.
用于绘制所有观测intensites的功能复制\第一个给定的数组中指定的控制探针。可以指定通过首先是一个ArrayAddress标识的向量和一套相应的字符标记的第二列列的1 ControlProfile数据框，控制探针的身份。要绘制的珠被发现positiveControlTags参数匹配这些字符标记。表达数据的用户可以有ControlProfile数据框自动在函数内定义，提供的beadLevelData对象已由readIllumina或setAnnotation定义的注释。


值----------Value----------

Plot to current graphical device
当前图形设备的图


作者（S）----------Author(s)----------



Mark Dunning




参考文献----------References----------

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。