R语言 beadarray包 plotChipLayout()函数中文帮助文档(中英文对照)

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plotChipLayout(beadarray)
plotChipLayout()所属R语言包：beadarray

                                         Function to Plot the Layout of an Illumina BeadChip
                                         函数来绘制布局Illumina的BeadChip

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Using the values obtained from a sentrix descriptor object generated by simpleXMLparse, a plot is generated showing samples and sections.
从sentrix描述生成的对象由simpleXMLparse取得值，有一个图是展示样品和部分产生的。


用法----------Usage----------


plotChipLayout(SD, subsC = NULL, sampC = NULL, sectC = NULL, desectC = "red", markC = "white", main = NULL, samplab = NULL, sectlab = NULL)



参数----------Arguments----------

参数：SD
A sentrix descriptor object such as that generated by simpleXMLparse from an Illumina sdf file  
如从Illumina的sdf文件simpleXMLparse产生sentrix描述符对象


参数：subsC
The colour for the array substrate.  Will be extracted from the sentrix descriptor object if null.  
阵列基板的颜色。如果的空sentrix描述对象将被提取。


参数：sampC
The colour for the samples.  Will be extracted from the sentrix descriptor object if null.  
样品的颜色。如果的空sentrix描述对象将被提取。


参数：sectC
The colour for the sections.  Will be extracted from the sentrix descriptor object if null.  
部分的颜色。如果的空sentrix描述对象将被提取。


参数：desectC
The colour with which to outline the decode sections  
勾勒解码部分的颜色


参数：markC
The colour for plotting decoding and analytical markers  
图解码和分析标记的颜色


参数：main
A title to give the figure (e.g. chip name)  
一个头衔给的数字（例如芯片的名称）


参数：samplab
labels for the samples.  Will be extracted from the sentrix descriptor object if null.  
对样品的标签。如果的空sentrix描述对象将被提取。


参数：sectlab
labels for the sections (if appropriate).  Will be extracted from the sentrix descriptor object if null.  
标签的部分（如适用）。如果的空sentrix描述对象将被提取。


值----------Value----------

returns a plot to the current device (recommend this is tall and thin)
返回到当前设备的小区（建议这是又高又瘦）


作者（S）----------Author(s)----------



Andy Lynch




举例----------Examples----------


## SD<-simpleXMLparse(mysdf)[＃的SD-simpleXMLparse（mysdf）]
## plotChipLayout(SD)[＃plotChipLayout（SD）的]


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