R语言 sperich包 species.range()函数中文帮助文档(中英文对照)

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species.range(sperich)
species.range()所属R语言包：sperich

                                        Species range estimation
                                         种范围估计

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function estimates the species range based on given occurences of one species.
这个函数估计的物种范围的基础上出现的一个物种。


用法----------Usage----------





参数----------Arguments----------

参数：dataset.one.species
A dataset containing one species with its ID  (named: speciesID) and the longitude (named: long) and  latitude (named: lat) of the occurence locations of that species.
数据集包含一个物种，其ID（名为：speciesID）和经度（命名为：长）和纬度（名为：纬度）的发生位置的物种。


参数：landwatermask
A grid containing the land-water-information of the observed area.  If a grid cell containes no land, the value of the cell in the  landwatermask is -1, otherwise it is 0. Additional, height-informations could  be added for land surfaces. In this case, take care of the 'upperbound' value.
的网格中所观察到的区域的土地与水的信息。一个的网格单元containes没有土地如果的landwatermask的单元格中的值是-1，否则为0。另外，土地表面高度的信息可以被添加。在这种情况下，照顾的“上界”的价值。


参数：distance
The maximum distance in which two occurences are considered as related occurences.  These two occurences will be connected with an edge.
两次出现错误的最大距离被认为是相关的出现次数。这两次出现错误，将与边缘连接。


参数：dimension
The dimension of the processed grid.
处理后的网格尺寸。


参数：shift
The geographic coordinates of the origin of the grid.
GEO坐标的网格原点。


参数：resolution
The resolution of the grid in (geographical) degree.
决议中的网格（区域）学位。


参数：upperbound
This value determines the height (based on values in 'landwatermask')  which is considered to be a barrier for species distribution.
此值确定的高度（基于价值观在“landwatermask”），这被认为是物种分布的障碍。


参数：cross.validation
A logical value determining wether a cross-validation is performed.
是一个逻辑值，确定羯羊交叉验证。


Details

详细信息----------Details----------

This routine estimates the species range based on given occurences of one species through  a geometric interpolation model (details in Raedig et al. 2010).
常规估计的物种范围的基础上出现的一个物种通过几何插值模型（详情在Raedig等2010）。


值----------Value----------

This function returns a grid which contains the species range information.
这个函数返回一个网格，其中包含的物种范围的信息。


（作者）----------Author(s)----------


Maximilian Lange, Sven Lautenbach



参考文献----------References----------

Reassessing Neotropical angiosperm distribution patterns based on  monographic data: a geometric interpolation approach. Biodivers Conserv, 19, 1523-1546.

实例----------Examples----------


##load data[＃加载数据]
data(dataset.all.species)
data(dataset.landwater)

##create grid parameters[＃创建网格参数。]
dimension <- getDimension(dataset.all.species, resolution=1)
shift <- getShift(dataset.all.species)

##create landwatermask[＃创建landwatermask]
landwatermask.nocoast <- createLandwatermask(dataset.landwater,
                                        dimension, shift, resolution=1)

##extract datasets of one species out of database[＃一个物种的数据库中提取的数据集]
dataset.one.species <- extract.species(dataset.all.species, 3)

##estimate species range[＃估计物种分布区范围]
species.range.tmp <- species.range(dataset.one.species, distance=5,
                        dimension, shift, resolution=1, landwatermask.nocoast)

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