searchClusters(sperich)
searchClusters()所属R语言包:sperich
Search clusters in the result grid of species richness estimation.
搜索群中物种丰富度估计的结果表格。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This routine searches clusters in the result grid of species richness estimation.
这个例程搜索聚类的物种丰富度估计的结果表格。
用法----------Usage----------
searchClusters(species.richness, dimension, shift, resolution, clusterlimit)
参数----------Arguments----------
参数:species.richness
The grid that should be adjusted. It contains the result of species richness estimation or cross-validation.
应调整的网格。它包含的物种丰富度估计或交叉验证的结果。
参数:dimension
The dimension of the processed grid.
处理后的网格尺寸。
参数:shift
The geographic coordinates of the origin of the grid.
GEO坐标的网格原点。
参数:resolution
The resolution of the grid in (geographical) degree.
决议中的网格(区域)学位。
参数:clusterlimit
The limit under which values of 'species.richness' should not be used to build clusters.
的限制下,值不应使用species.richness的建立聚类。
Details
详细信息----------Details----------
This routine searches clusters in the result grid of species richness estimation to find centers of species richness.
这个例程搜索群物种丰富度估计的结果表格中找到的物种丰富度的中心。
值----------Value----------
This function returns a list containing vectors of the position of pixels which belong together.
这个函数返回一个列表,其中包含的像素属于一起的位置向量。
(作者)----------Author(s)----------
Maximilian Lange, Sven Lautenbach
参考文献----------References----------
Reassessing Neotropical angiosperm distribution patterns based on monographic data: a geometric interpolation approach. Biodivers Conserv, 19, 1523-1546.
实例----------Examples----------
##load data[#加载数据]
data(dataset.all.species)
data(dataset.landwater)
##create grid parameters[#创建网格参数。]
dimension <- getDimension(dataset.all.species, resolution=1)
shift <- getShift(dataset.all.species)
##create landwatermask[#创建landwatermask]
landwatermask.nocoast <- createLandwatermask(dataset.landwater,
dimension, shift, resolution=1)
##estimate species richness[#估计物种丰富度]
species.richness.weighted <- species.richness(dataset.all.species,
landwatermask.nocoast, distances=1:10, weight=0.5, dimension,
shift, resolution=1, upperbound=3000, all.species=1:20)
##prepare clustersearch[#准备clustersearch]
clusterlimit <- 100
##adjust species richness[#调整物种丰富度]
clusterlist <- searchClusters(species.richness.weighted,
dimension, shift, resolution=1, clusterlimit)
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注:
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