R语言 SpectralGEM包 InFile()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

InFile(SpectralGEM)
InFile()所属R语言包：SpectralGEM

                                        Generate a text file
                                         生成一个文本文件

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The function generates a text file that contains the parameters needed in  the main fortran program and saves it in the current directory.
该函数生成一个文本文件，其中包含主要的Fortran程序所需要的参数，并将其保存在当前目录中。


用法----------Usage----------


InFile(identifier="smal",stage="1",directory="./",
                    MMfile="MMprime.txt",excludefile="exclude.txt",
                    idlength=8,mincluster=10,logtype=0,
                    mdim=-1,msnp=-1,
                    outfile="matching_input.txt")



参数----------Arguments----------

参数：identifier
Must be 4-letters long.
必须是4个字母长。


参数：stage
Must be 1-letter long.
必须是1个字母长。


参数：directory
The directory where the files will be generated.
该文件所在的目录，将产生。


参数：MMfile
The MMprime matrix file name.
MMprime矩阵的文件名。


参数：excludefile
The name of the file where the outliers have been or will be written.
该文件的名称的离群值已经或将被写入。


参数：idlength
The number of letters the longest sample name has.
最长的样品名称的字母。


参数：mincluster
The smallest cluster required when do clustering, must be at least 5.
的最小簇需要做聚类时，必须至少为5。


参数：logtype
The type of log information output to the log file: 0=limited, 2=lots.
该类型的log信息输出到log文件中：0 = 2 =有限，很多。


参数：mdim
The maximum number of eigenvalues to print to the output file. The default is set at -1, which prints out every eigenvalues.
打印到输出文件的最大数量的特征值。的默认设置为-1，打印出每一个特征值。


参数：msnp
The number of SNPs to be used in determine the threshold for the significant eigenvalues. The default is set at -1, which the program estimates the value.
中要使用的SNPs的数目确定的阈值的显着的特征值。默认值设置为-1，该计划估计值。


参数：outfile
The name of the output file.
的输出文件的名称。


Details

详细信息----------Details----------

The function generates a text file with one column which contains all the  parameters needed. The parameters need to be in the right order in order  for the main fortran program to use.  
该函数生成一个文本文件，其中一列，其中包含了所有需要的参数。需要的参数是按照正确的顺序fortran程序的主要使用顺序。


值----------Value----------

A text file is saved in the current directory.
一个文本文件，保存在当前目录中。


（作者）----------Author(s)----------


Ann Lee, Diana Luca, Bert Klei, Bernie Devlin, and Kathryn
Roeder


Maintainer: Jing Wu jwu@stat.cmu.edu



参考文献----------References----------

<h3>See Also</h3>
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