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R语言 beadarray包 checkRegistration()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 12:40:21 | 显示全部楼层 |阅读模式
checkRegistration(beadarray)
checkRegistration()所属R语言包:beadarray

                                         Perform check for misregistered array segments.
                                         执行检查,为misregistered数组段。

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Occasionally the registration of an array can go wrong, with the bead centres found in the wrong place in an image.  The effective result of this is a scrambling of the bead IDs.  
偶尔登记数组可以去错了,在图像中的错误的地方发现了珠中心。这种有效的结果是一个扰珠的ID。

Note that the function requires that the sdf file and locs file are present, and has particular expectations towards their file names and locations.
请注意该函数需要sdf文件和LOCS文件都存在,并有特别的期望,对他们的文件名称和位置。


用法----------Usage----------


    checkRegistration(BLData, array = 1)



参数----------Arguments----------

参数:BLData
An object of class beadLevelData-class.
对象类beadLevelData-class。


参数:array
Integer specifying the index of the arrays to be checked.  Can be a vector to process multiple arrays e.g. 1:12.
整数,指定索引的阵列进行检查。可以是一个向量处理例如多个阵列1:12。


Details

详情----------Details----------

In order to check for mis-registration we can examine the within bead-type variance across the array.  This function computes this statistic twice for each array segment (since each segment is registered independently), once using the given bead IDs and once using a randomly assigned set of IDs.  The former is then subtracted from the later.  In cases where the registration has worked successfully we expect the majority of these values to be greater than zero, which for misregistered arrays the differences should be centred about zero.
为了检查登记错误,我们可以在阵列内珠型变异研究。每个阵列段(每段独立注册)此函数计算统计两次,一次使用给定的珠ID和一次使用随机分配的ID。从后来再减去前者。在登记工作成功的情况下,我们预计大多数这些值大于零,其中misregistered阵列的差异应为零中心。


值----------Value----------

Returns an object of class beadRegistrationData.
类beadRegistrationData返回一个对象。


作者(S)----------Author(s)----------



Mike Smith




参考文献----------References----------


转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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