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R语言 beadarray包 beadLevelData-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 12:39:40 | 显示全部楼层 |阅读模式
beadLevelData-class(beadarray)
beadLevelData-class()所属R语言包:beadarray

                                        Class "beadLevelData"
                                         类“beadLevelData”

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A class for storing red and green channel foreground and background intensities from an Illumina experiment.
A类用于存储从Illumina的实验红色和绿色通道的前景和背景强度。


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects can be created by calls of the form new("beadLevelData"), but are usually created by readIllumina.
可以通过检测的形式new("beadLevelData")创建对象,但通常是由readIllumina创建。


角子机/列表组件----------Slots/List Components----------

Objects of this class contain the following slots
这个类的对象包含以下插槽

A list of arrays, indexed by array name.  Each item in this list is itself a list, containing enviroments holding the data for that array.
一个数组列表,数组名索引。在此列表中的每个项目本身就是一个列表,包含的环境里,持有该阵列的数据。

a list containing information. Each item in the list is a data frame containing one row for each section
列表中包含的信息。列表中的每个项目是一个数据框,每个部分包含一行

a list containing the annotation of the platform, link to the sdf file and type of data (slide or Sentrix Array Matrix)
列表中包含的平台,链接注释SDF文件和数据类型(幻灯片或Sentrix阵列矩阵)


方法----------Methods----------




show(beadLevelData) Printing method for BeadLevelList
秀(beadLevelData)BeadLevelList的打印方法




sectionNames(object,arrays=NULL) Returns the strip/array names from a
sectionNames(object,arrays=NULL)返回从一个带/数组名




numBeads(object,arrays=NULL) Returns the number of beads on selected arrays
numBeads(object,arrays=NULL)返回选定arrays珠


从类访问数据----------Accessing data from the class----------




getBeadData retrieve data
getBeadData检索数据




insertBeadData Input or modify existing data
insertBeadData输入或修改现有的数据


作者(S)----------Author(s)----------


Mark Dunning, Mike Smith



参见----------See Also----------

readIllumina
readIllumina


举例----------Examples----------



if(require(beadarrayExampleData)){


data(exampleBLData)

sectionNames(exampleBLData)

head(exampleBLData[[1]])

getBeadData(exampleBLData, array=1, what="Grn")[1:10]


}


转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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