segmentate(beadarraySNP)
segmentate()所属R语言包:beadarraySNP
Segmentation for SnpSetIllumina objects
SnpSetIllumina对象分割
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Use snapCGH package to perform segmentation
使用snapCGH包执行分割
用法----------Usage----------
segmentate(object, method = c("DNACopy", "HMM", "BioHMM", "GLAD"), normalizedTo = 2, doLog = TRUE,
doMerge = FALSE, useLair = FALSE, subsample = "OPA", alpha = 0.01)
参数----------Arguments----------
参数:object
class SnpSetIllumina
类SnpSetIllumina
参数:method
char, type of segmentation
CHAR,分割类型
参数:normalizedTo
numeric
数字
参数:doLog
logical, perform transformation before segmentation, see convert2seglist
逻辑,执行分割改造前,看到convert2seglist
参数:doMerge
logical, perform merging of close states
逻辑,执行合并关闭状态
参数:useLair
logical, Also segmentate on lair
逻辑,也segmentate上的巢穴
参数:subsample
factor
因素
参数:alpha
numeric, probability threshold to distinguish segments
数字,概率阈值来区分分部
值----------Value----------
SnpSetIllumina object with elements observed, states and predicted set in the AssayData slot
与元素SnpSetIllumina的对象observed, states and predicted设置AssayData插槽
作者(S)----------Author(s)----------
Jan Oosting
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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