R语言 beadarraySNP包 removeLowQualitySamples()函数中文帮助文档(中英文对照)

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removeLowQualitySamples(beadarraySNP)
removeLowQualitySamples()所属R语言包：beadarraySNP

                                        Quality control of SnpSetIllumina objects
                                         质量控制SnpSetIllumina对象

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Remove samples from a SnpSetIllumina object that show a low quality
删除从SnpSetIllumina对象的样本显示低质量


用法----------Usage----------


removeLowQualitySamples(object, min.intensity = 1500, min.gt = 100, subsample = "OPA")



参数----------Arguments----------

参数：object
SnpSetIllumina-class object
SnpSetIllumina-class对象


参数：min.intensity
numeric. Samples that show a median intensity below this  value in either Red or Green channel are removed
numeric。显示红色或绿色通道低于这个值的平均强度的样品被删除


参数：min.gt
numeric. Samples that have less than this amount of valid  genotypes are removed
numeric。样品有不到这种有效的基因型金额被删除


参数：subsample
factor or column name in featureData slot of object
因素或列名在的featureData插槽object


值----------Value----------

This function returns an SnpSetIllumina object.
此函数返回一个SnpSetIllumina对象。


作者（S）----------Author(s)----------


Jan Oosting



举例----------Examples----------


  data(chr17.260)
  chr17.260<-removeLowQualitySamples(chr17.260,min.gt=10)

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